Krigen hadde fullstendig ødelagt Sør og stilt alvorlige spørsmål om hvordan Sør ville bli re-integrert i unionen.Krigen ødela mye av rikdommen som hadde eksistert i Sør.Alle akkumulerte investeringer i konfødererte obligasjoner ble tapt;de fleste banker og jernbaner var konkurs.Inntekten per person i sør falt til under 40 prosent av den i nord, en tilstand som varte til langt ut på 1900-tallet.Sørlig innflytelse i den føderale regjeringen, tidligere betydelig, ble sterkt redusert frem til siste halvdel av 1900-tallet.Gjenoppbyggingen begynte under krigen, med frigjøringserklæringen av 1. januar 1863, og den fortsatte til 1877. Den omfattet flere komplekse metoder for å løse de utestående problemene etter krigens etterspill, hvorav de viktigste var de tre "gjenoppbyggingsendringene" til Grunnloven: den 13. forbyder slaveri (1865), den 14. garanterer statsborgerskap til slaver (1868) og den 15. sikrer stemmerett til slaver (1870).Tallrike teknologiske nyvinninger under borgerkrigen hadde stor innvirkning på vitenskapen på 1800-tallet.Borgerkrigen var et av de tidligste eksemplene på en "industrikrig", der teknologisk makt brukes for å oppnå militær overherredømme i en krig.Nye oppfinnelser, som toget og telegrafen, leverte soldater, forsyninger og meldinger i en tid da hester ble ansett for å være den raskeste måten å reise på.Det var også i denne krigen at luftkrigføring, i form av rekognoseringsballonger, først ble tatt i bruk.Det så den første handlingen som involverte dampdrevne jernbelagte krigsskip i marinekrigføringshistorien.Gjentatte skytevåpen som Henry-riflen, Spencer-riflen, Colt-roterende rifle, Triplett & Scott-karabin og andre, dukket først opp under borgerkrigen;de var en revolusjonerende oppfinnelse som snart skulle erstatte munnings- og enkeltskuddsskytevåpen i krigføring.Krigen så også de første opptredenene av hurtigskytende våpen og maskingevær som Agar-pistolen og Gatling-pistolen.