Jackson fikk vite klokken 07.00 at Federals nærmet seg kolonnen hans.Uten skikkelig rekognosering eller å vente på at hoveddelen av styrken hans skulle komme opp, beordret han Winder's Stonewall Brigade til å ta seg gjennom den tynnende tåken.Brigaden ble fanget mellom artilleri på flanken og riflesalver foran og falt tilbake i uorden.De hadde kjørt inn i to brigader ved fortroppen til Shields hær, 3000 mann under brig.Gen. Erastus B. Tyler.I et forsøk på å komme seg ut av en potensiell katastrofe, innså Jackson at Unionens artilleriild kom fra en utløper av Blue Ridge.Jackson og Winder sendte 2. og 4. Virginia infanteriregimenter gjennom den tykke krattskogen opp bakken, hvor de møtte tre unionsinfanteriregimenter som støttet artilleriet og ble slått tilbake.Etter at angrepet hans på Coaling mislyktes, beordret Jackson resten av Ewells divisjon, først og fremst Trimbles brigade, å krysse over North River-broen og brenne den bak seg, og holde Frémonts menn isolert nord for elven.Mens han ventet på at disse troppene skulle ankomme, forsterket Jackson sin linje med det 7. Louisiana-infanteriet fra Taylors brigade og beordret Taylor til å gjøre et nytt forsøk mot unionsbatteriene.Winder oppfattet at Federals var i ferd med å angripe, så han beordret en forebyggende ladning, men i møte med skarpe salver og lite ammunisjon, ble Stonewall Brigade dirigert.På dette tidspunktet ankom Ewell slagmarken og beordret 44. og 58. Virginia infanteriregimenter å slå til venstre flanke av den fremrykkende unionsslaglinjen.Tylers menn falt tilbake, men omorganiserte seg og kjørte Ewells menn inn i skogen sør for Coaling.Taylor angrep infanteriet og artilleriet på Coaling tre ganger før han seiret, men etter å ha oppnådd målet sitt, ble han møtt av en ny anklage fra tre Ohio-regimenter.Det var bare den overraskende opptredenen av Ewells tropper som overbeviste Tyler om å trekke mennene sine tilbake.De konfødererte begynte å bombardere unionstroppene på de flate landene, mens Ewell selv bemannet en av kanonene med glede.Flere konfødererte forsterkninger begynte å ankomme, inkludert brigaden til Brig.General William B. Taliaferro, og unionshæren begynte motvillig å trekke seg tilbake.Jackson sa til Ewell: "General, den som ikke ser Guds hånd i dette er blind, sir, blind."Fremdriften til Jackson hadde forrådt ham til å angripe før troppene hans var tilstrekkelig samlet, noe som ble vanskeliggjort av de utilstrekkelige midlene til å krysse elven.Slaget ved Port Republic hadde blitt dårlig administrert av Jackson og var det mest skadelige for konføderasjonene når det gjelder tap - 816 mot en styrke som var halvparten av størrelsen hans (omtrent 6000 til 3500).Fagforeningens tap var 1002, med en høy prosentandel som representerte fanger.Etter de doble nederlagene ved Cross Keys og Port Republic, trakk unionshærene seg tilbake, og etterlot Jackson kontroll over øvre og midtre Shenandoah-dalen og frigjorde hæren hans for å forsterke Robert E. Lee før Richmond i Seven Days Battles.