Het geboortejaar van Temüjin wordt betwist, aangezien historici verschillende data verkiezen: 1155, 1162 of 1167. Sommige tradities plaatsen zijn geboorte in het Jaar van het Varken, dat 1155 of 1167 was. Hoewel een datering uit 1155 wordt ondersteund door de geschriften van zowel Zhao Hong als Rashid al-Din, andere belangrijke bronnen zoals de Geschiedenis van Yuan en de Shengwu geven de voorkeur aan het jaar 1162. De datering van 1167, favoriet door Paul Pelliot, is afgeleid van een kleine bron: een tekst van de Yuan-kunstenaar Yang Weizhen – maar is beter verenigbaar met de gebeurtenissen in het leven van Genghis Khan dan een plaatsing in 1155, wat impliceert dat hij pas na zijn dertigste kinderen kreeg en tot in zijn zevende decennium actief campagne bleef voeren. 1162 blijft de meest geaccepteerde datum; de historicus Paul Rathnevsky merkt op dat Temüjin zelf de waarheid misschien niet kende. Over de geboorteplaats van Temüjin wordt op soortgelijke wijze gedebatteerd: de geheime geschiedenis vermeldt zijn geboorteplaats als Delüün Boldog aan de rivier de Onon, maar deze is geplaatst in Dadal in de provincie Khentii of in het zuiden van Agin-Buryat Okrug, Rusland.

Temüjin werd geboren in de Borjigin-clan van de Mongoolse stam als zoon van Yesügei, een stamhoofd die beweerde af te stammen van de legendarische krijgsheer Bodonchar Munkhag, en zijn belangrijkste vrouw Hö'elün, oorspronkelijk van de Olkhonud-clan, die Yesügei had ontvoerd van haar Merkit-bruidegom Chiledu. De oorsprong van zijn geboortenaam wordt betwist: volgens de vroegste tradities was zijn vader net teruggekeerd van een succesvolle campagne tegen de Tataren met een gevangene genaamd Temüchin-uge, naar wie hij de pasgeborene noemde ter viering van zijn overwinning, terwijl latere tradities benadruk de wortel temür (wat 'ijzer' betekent) en sluit aan bij theorieën dat 'Temüjin' 'smid' betekent. Yesügei en Hö'elün hadden na Temüjin drie jongere zonen: Qasar, Hachiun en Temüge, evenals een dochter, Temülen. Temüjin had ook twee halfbroers, Behter en Belgutei, van Yesügei's tweede vrouw Sochigel, wiens identiteit onzeker is. De broers en zussen groeiden op in het hoofdkamp van Yesugei aan de oevers van de Onon, waar ze leerden paardrijden en boogschieten.

Toen Temüjin acht jaar oud was, besloot Yesügei hem te verloven met een geschikt meisje. Hij nam zijn erfgenaam mee naar de weilanden van Hö'elüns prestigieuze Onggirat-stam, die al vaker met de Mongolen was getrouwd. Daar regelde hij een verloving tussen Temüjin en Börte, de dochter van een Onggirat-leider genaamd Dei Sechen. Omdat de verloving betekende dat Yesügei een machtige bondgenoot zou krijgen, en omdat Börte een hoge bruidsprijs afdwong, bekleedde Dei Sechen de sterkere onderhandelingspositie en eiste hij dat Temüjin in zijn huishouden zou blijven om zijn toekomstige schulden af ​​te betalen. Yesügei accepteerde deze voorwaarde en vroeg om een ​​maaltijd bij een bende Tataren die hij tegenkwam terwijl hij alleen naar huis reed, vertrouwend op de steppetraditie van gastvrijheid jegens vreemden. De Tataren herkenden echter hun oude vijand en lieten gif in zijn eten glijden. Yesügei werd geleidelijk ziek, maar slaagde erin naar huis terug te keren; bijna dood vroeg hij een vertrouwde vazal genaamd Münglig om Temüjin van de Onggirat op te halen. Hij stierf kort daarna.

Op achtjarige leeftijd werd Temüjin door zijn vader Yesügei verloofd met Börte, dochter van Onggirat-opperhoofd Dei Sechen, om door middel van een huwelijk een alliantie veilig te stellen. Deze unie maakte Temüjin noodzakelijk om bij de Onggirats te blijven en aan de verplichtingen jegens de familie van zijn toekomstige bruid te voldoen. Op zijn terugreis kwam Yesügei, vergiftigd door de Tataren die hij tegenkwam, ternauwernood thuis voordat hij bezweek aan het gif. Voordat hij stierf, regelde hij dat Temüjin werd teruggehaald bij de Onggirats via een loyale vazal, Münglig.

Na de dood van Yesügei werd zijn familie, geleid door de jonge Temüjin en zijn moeder Hö'elün, in de steek gelaten door hun clan, de Borjigin, en hun bondgenoten, vanwege de jonge leeftijd van Temüjin en zijn broer Behter. Ondanks dat sommige bronnen familiale steun suggereren, schildert de meerderheid de familie van Hö'elün af als een verschoppeling, wat leidt tot een moeilijk jager-verzamelaarsbestaan. De spanningen over erfenis en leiderschap tussen Temüjin en Behter escaleerden, culminerend in de dood van Behter door Temüjin en zijn broer Qasar. Temüjin vormde op elfjarige leeftijd een cruciale vriendschap met Jamukha, een jongen van adellijke afkomst. Ze versterkten hun band door geschenken uit te wisselen en het Anda-pact te zweren, een Mongoolse traditie die bloedbroederschap betekent.

Tijdens deze periode van kwetsbaarheid werd Temüjin geconfronteerd met verschillende arrestaties. Hij ontsnapte uit de Tayichiuds met de hulp van Sorkan-Shira, die hem onderdak bood, en later Bo'orchu, die hem op een cruciaal moment bijstond en zijn eerste nökor werd, waarmee hij Temüjins opkomende leiderschap en charisma demonstreerde.

Op vijftienjarige leeftijd trouwde Temüjin (Genghiz) met Börte, samen met Dei Sechen, haar vader, die hem hartelijk verwelkomde en het paar geschenken overhandigde, waaronder een dure sabelmantel voor Hö'elün. Op zoek naar steun sloot Temüjin een bondgenootschap met Toghrul, khan van de Kerait-stam, door hem de sabelmantel te schenken, zijn bescherming veilig te stellen en zijn eigen aanhang op te bouwen, met figuren als Jelme die zich bij zijn gelederen voegden. Gedurende deze periode verwelkomden Temüjin en Börte hun eerste kind, een dochter genaamd Qojin.

Als vergelding voor Yesügei's eerdere ontvoering van Hö'elün vielen ongeveer 300 Merkits het kamp van Temüjin aan, waarbij ze Börte en Sochigel ontvoerden. Börte werd volgens de leviraatwet tot een huwelijk gedwongen. Temüjin zocht hulp bij Toghrul en zijn bloedbroeder Jamukha, nu een stamhoofd, die een leger van 20.000 krijgers verzamelden. Ze hebben met succes Börte gered, die zwanger was en later het leven schonk aan Jochi, wiens vaderschap in twijfel werd getrokken, maar door Temüjin werd opgevoed als het zijne. In de daaropvolgende jaren kregen Temüjin en Börte nog drie zonen - Chagatai, Ögedei en Tolui - en vier dochters, wat de groeiende bekendheid van de familie onderstreepte.

Na anderhalf jaar samen te hebben gekampeerd en hun Anda-pact te hebben versterkt, leidden de spanningen tussen Temüjin en Jamukha tot hun scheiding, mogelijk onder invloed van Börte's ambities. Terwijl Jamukha de steun van grote stamheersers behield, trok Temüjin eenenveertig leiders en talrijke volgers aan, waaronder opmerkelijke figuren als Subutai van verschillende stammen.

De volgelingen van Temüjin verklaarden hem tot khan van de Mongolen, wat Toghrul behaagde maar Jamukha's wrok opwekte. Deze spanning leidde rond 1187 tot een slag bij Dalan Baljut, waar Temüjin een nederlaag tegen de strijdkrachten van Jamukha te verduren kreeg, ondanks tegenstrijdige verhalen van latere historici zoals Rashid al-Din, die suggereren dat Temüjin als overwinnaar uit de strijd kwam.

De slag om Dalan Baljut in 1187 markeerde een cruciaal conflict tussen Temüjin (toekomstige Genghis Khan) en zijn ooit goede vriend Jamukha. Uiteenlopende politieke ideologieën – Jamukha's steun voor de traditionele Mongoolse aristocratie versus Temüjins voorkeur voor meritocratie – voedden hun scheiding. Ondanks Temüjins brede steunbasis, succesvolle campagnes en de benoeming tot Khan in 1186, leidde Jamukha's aanval met 30.000 troepen tot de nederlaag van Temüjin en zijn daaropvolgende verdwijning gedurende een decennium. Jamukha's harde behandeling van gevangenen na de strijd, waaronder het levend koken van zeventig jongeren, weerhield potentiële bondgenoten ervan.

Na de slag om Dalan Baljut suggereren historici Ratchnevsky en Timothy May dat Temüjin waarschijnlijk een aanzienlijke periode de Jurchen Jin-dynastie in Noord-China heeft gediend, een bewering die wordt ondersteund door Zhao Hong's verslagen over Temüjins slavernij door de Jin. Dit idee, ooit afgedaan als nationalistische overdrijving, wordt nu als plausibel beschouwd en vult een leemte in de bekende activiteiten van Temüjin tot rond 1195. Zijn succesvolle terugkeer met aanzienlijke macht duidt op een gunstige periode bij de Jin, ondanks de afwezigheid van de episode in de Mongoolse historische verslagen. waarschijnlijk vanwege het potentieel om het Mongoolse prestige aan te tasten.

In de vroege zomer van 1196 zag Temüjin bij zijn terugkeer naar de steppe zijn krachten bundelen met de Jin-dynastie tegen de Tataren, die tegen de belangen van Jin waren. Voor zijn bijdragen eerden de Jin hem met de titel cha-ut kuri, verwant aan "commandant van honderden" in Jurchen. Tegelijkertijd hielp hij Toghrul bij het herwinnen van de controle over de Kereit, waarbij hij een usurpatie uitdaagde die werd gesteund door de Naiman-stam. Deze acties in 1196 verhoogden met name de status van Temüjin van Toghruls vazal tot een positie van gelijkwaardige bondgenoot, waardoor zijn invloed in de steppedynamiek veranderde.

In de jaren voorafgaand aan 1201 voerden Temüjin en Toghrul campagnes tegen de Merkits, Naimans en Tataren, zowel gezamenlijk als afzonderlijk. Ontevreden stammen, waaronder de Onggirat, Tayichiud en Tataren, verenigden zich onder Jamukha als hun leider, in een poging een einde te maken aan de dominantie van Borjigin-Kereit. Temüjin en Toghrul versloegen deze coalitie echter op beslissende wijze bij Yedi Qunan, waardoor Jamukha gedwongen werd de genade van Toghrul te zoeken. Met het oog op totale controle over Oost-Mongolië veroverde Temüjin de Tayichiud en de Tataren tegen 1202, executeerde hun leiders en integreerde hun strijders in zijn strijdkrachten. Opvallend onder zijn nieuwe krijgers waren Sorkan-Shira, een voormalige bondgenoot, en Jebe, een jonge krijger die het respect van Temüjin verdiende door moed en vaardigheid in de strijd te tonen.

Nu de Tataren waren geabsorbeerd, concentreerde de machtsdynamiek van de steppe zich rond de Naimans, Mongolen en Kereits. Temüjins huwelijksaanzoek voor zijn zoon Jochi aan een van Toghruls dochters wekte argwaan onder de Kereit-elite, geleid door Toghruls zoon Senggum, en beschouwde het als een manoeuvre voor controle, verergerd door twijfels over Jochi's vaderschap. Jamukha benadrukte verder Temüjins uitdaging voor de steppe-aristocratie door het bevorderen van gewone mensen en het ontwrichten van traditionele hiërarchieën. Toghrul, beïnvloed door deze zorgen, plande een hinderlaag tegen Temüjin, die werd verijdeld door gewaarschuwde herders. Ondanks het mobiliseren van enkele troepen, werd Temüjin geconfronteerd met een aanzienlijke nederlaag in de Slag om Qalaqaljid Sands.

Na tegenslagen trok Temüjin zich terug in Baljuna om zijn troepen te hergroeperen. Terwijl Bo'orchu te voet was en zijn zoon Ögedei gewond maar geholpen door Borokhula, verzamelde Temüjin alle bondgenoten en stelde het Baljuna-verbond in. Deze eed van loyaliteit, die exclusiviteit en prestige beloofde, werd afgelegd door een diverse groep uit negen stammen, waaronder christenen, moslims en boeddhisten, verenigd door hun trouw aan Temüjin.

Met behulp van tactisch bedrog onder leiding van Qasar vielen de Mongolen onverwachts de Kereit op Jej'er Heights aan. De strijd, die drie dagen duurde, werd afgesloten met een belangrijke overwinning voor Temüjin. Zowel Toghrul als Senggum werden gedwongen te vluchten; Senggum vluchtte naar Tibet, terwijl Toghrul aan zijn einde kwam door toedoen van een Naiman die hem niet herkende. Temüjin integreerde vervolgens het leiderschap van Kereit in zijn gelederen, trouwde met prinses Ibaqa en regelde huwelijken van haar zus Sorghaghtani en nichtje Doquz met zijn jongste zoon, Tolui. De Naiman-troepen, versterkt door Jamukha en anderen verslagen door de Mongolen, bereidden zich voor op conflicten. Op de hoogte gebracht door Alaqush, heerser van de Ongud-stam, stond Temüjin in mei 1204 tegenover de Naimans in Chakirmaut in het Altai-gebergte, waar ze een verpletterende nederlaag leden; Tayang Khan werd gedood en zijn zoon Kuchlug vluchtte naar het westen. De Merkits werden later datzelfde jaar aanzienlijk verzwakt. Jamukha, die de Naimans tijdens Chakirmaut had verlaten, werd door zijn eigen mannen aan Temüjin verraden, die vervolgens wegens hun verraad werden geëxecuteerd. The Secret History vermeldt dat Jamukha om een ​​eervolle executie van zijn jeugdvriend had verzocht, terwijl andere bronnen beweren dat hij in stukken was gehakt.

Van 1204 tot 1209 breidde Genghis Khan de Mongoolse invloed uit. Hij stuurde Jochi in 1207 naar het noorden om stammen in Siberië te veroveren, waarbij hij toegang kreeg tot waardevolle hulpbronnen zoals graan, bont en goud door met de oirat-mongolen te trouwen en de Yenisei Kirgiziërs te verslaan. De Mongolen trokken ook naar het westen, overwonnen een Naiman-Merkit-coalitie en verzekerden zich van de trouw van de Oeigoeren, wat de eerste onderwerping van de Mongolen vanuit een gevestigde samenleving markeerde.

Genghis begon in 1205 het westelijke Xia-koninkrijk aan te vallen, deels als vergelding tegen hun bescherming van Senggum en om de Mongoolse economie een impuls te geven door middel van invallen. De zwakke noordelijke verdedigingswerken van de Xia leidden tot Mongoolse overwinningen, waaronder de verovering van het fort Wulahai in 1207. In 1209 leidde Genghis persoonlijk een invasie, waarbij hij Wulahai opnieuw veroverde en oprukte naar de hoofdstad van Xia. Ondanks aanvankelijke tegenslagen en een mislukte belegering vanwege onvoldoende uitrusting, slaagde Genghis erin een tactische terugtocht te plegen die de Xia in een kwetsbare positie bracht, wat tot hun nederlaag leidde.

De belegering van de Xia-hoofdstad kwam tot stilstand vanwege het gebrek aan belegeringstechnologie van de Mongolen, en een mislukte poging om de stad onder water te zetten leidde tot een Mongoolse terugtocht nadat de dam brak. Uiteindelijk werd er vrede gesloten met de Xia die zich onderwierpen aan de Mongoolse heerschappij in ruil voor het stoppen van de aanvallen, waarbij de Xia-keizer eerbetoon, inclusief zijn dochter, naar Genghis stuurde.

In 1206 werd Temüjin tijdens een grote bijeenkomst aan de rivier de Onon uitgeroepen tot Genghis Khan, een titel met een betwiste oorsprong. Sommigen zeggen dat het kracht of universele heerschappij betekent, terwijl anderen beweren dat het weinig meer betekende dan een breuk met traditionele titels. Genghis Khan regeert nu over een miljoen mensen en initieerde een sociale reorganisatie om de loyaliteit aan stammen te ontmantelen, waarbij hij uitsluitend loyaliteit aan hem en zijn familie bevoordeelde, waardoor een gecentraliseerde staat ontstond. Traditionele stamleiders waren grotendeels verdwenen, waardoor Genghis zijn familie kon verheffen tot de 'Gouden Familie' bovenaan de sociale structuur, met een nieuwe aristocratie en loyale families daaronder.

Genghis herstructureerde de Mongoolse samenleving tot een militair decimaal systeem, waarbij mannen van vijftien tot zeventig jaar werden ingedeeld in eenheden van duizend, verder onderverdeeld in honderden en tientallen. Deze structuur omvatte ook families, waardoor militaire en maatschappelijke functies effectief werden gecombineerd om loyaliteit rechtstreeks aan Genghis te garanderen en stammenopstanden te voorkomen.

Hoge commandanten, of nökod, zoals Bo'orchu en Muqali, kregen belangrijke militaire rollen toegewezen, wat de meritocratische aanpak van Genghis demonstreerde. Zelfs degenen van bescheiden afkomst kregen het bevel, wat aantoont dat Genghis de nadruk legt op loyaliteit en verdienste boven het geboorterecht. Sommige commandanten mochten hun stamidentiteit behouden, een concessie voor hun loyaliteit.

Bovendien speelde de uitbreiding van de keshig, de lijfwacht van de khan, een cruciale rol. Aanvankelijk was het een kleine garde, maar het aantal groeide tot 10.000. Ze vervulden verschillende rollen, van persoonlijke bescherming tot administratie, en fungeerden als oefenterrein voor toekomstige leiders. Deze elitegroep genoot privileges en directe toegang tot Genghis Khan, waardoor hun loyaliteit werd veiliggesteld en hen werd voorbereid op hoger bevel.

In 1209 eigende Wanyan Yongji zich de Jin-troon toe. Hij had eerder aan de steppegrens gediend en Genghis had een grote hekel aan hem. Toen Yongji in 1210 eerbetoon eiste, trotseerde Genghis hem openlijk, wat de weg vrijmaakte voor oorlog. Ondanks de mogelijkheid dat 600.000 Jin-soldaten met acht tegen één in de minderheid zouden zijn, had Genghis sinds 1206 voorbereidingen getroffen voor een invasie vanwege Jin-kwetsbaarheden. Genghis had twee doelen: wraak nemen voor het onrecht dat de Jin in het verleden had begaan, waaronder de dood van Ambaghai Khan halverwege de 12e eeuw, en de enorme hoeveelheden buit binnenhalen die zijn troepen en vazallen verwachtten.

In maart 1211, na het organiseren van een kurultai, startte Genghis Khan zijn invasie van Jin China, waarbij hij in juni snel de grensverdediging van de Jin bereikte en omzeilde met hulp van de Ongud-stam. De invasiestrategie was gericht op wijdverbreide plunderingen en branden om de hulpbronnen en legitimiteit van Jin te ondermijnen, terwijl het doel was om strategische bergpassen te controleren voor verdere vooruitgang. De Jin werden geconfronteerd met aanzienlijke territoriale verliezen en een golf van afvalligheid, wat met name bijdroeg aan Muqali's belangrijke overwinning bij Huan'erzhui eind 1211. De campagne stopte echter in 1212 omdat Genghis gewond raakte door een pijl tijdens het beleg van Xijing. Deze tegenslag bracht hem ertoe een gespecialiseerde belegeringseenheid op te richten, met 500 Jin-specialisten om zijn militaire capaciteiten te vergroten.

In 1213 overwonnen de Mongolen de versterkte verdediging van de Juyongpas, geleid door Jebe, en creëerden zo een pad naar Zhongdu (nu Peking). De politieke structuur van de Jin verzwakte aanzienlijk toen de Khitans in opstand kwamen en Hushahu, de militaire leider in Xijing, een staatsgreep pleegde, waarbij Yongji werd vermoord en Xuanzong als marionettenleider werd geïnstalleerd. Ondanks hun aanvankelijke succes kreeg het leger van Genghis te maken met tegenslagen, waaronder ziektes en voedseltekorten, wat leidde tot erbarmelijke omstandigheden en vredesonderhandelingen. Genghis slaagde erin aanzienlijke eerbetoon aan de Jin te onttrekken, waaronder paarden, slaven, een prinses en waardevolle goederen, en trok zich vervolgens in mei 1214 terug.

Nadat de noordelijke Jin-regio's waren verwoest, verplaatste Xuanzong de hoofdstad naar Kaifeng, een zet die Genghis Khan beschouwde als een schending van hun vredesverdrag, wat hem ertoe aanzette een nieuwe aanval op Zhongdu te plannen. Historicus Christopher Atwood merkt op dat deze beslissing de toewijding van Genghis markeerde om Noord-China te veroveren. Gedurende de winter van 1214–1215 nam Muqali met succes veel steden over, wat leidde tot de overgave van Zhongdu in mei 1215, hoewel de stad te maken kreeg met plunderingen. Genghis keerde in 1216 terug naar Mongolië en liet Muqali achter om toezicht te houden op de operaties in China, waar hij de Jin bleef uitdagen tot aan zijn dood in 1223.

De Slag om Zhongdu (het huidige Peking) was een veldslag in 1215 tussen de Mongolen en de JurchenJin-dynastie , die Noord-China controleerde. De Mongolen wonnen en zetten hun verovering van China voort. De strijd om Peking was lang en vermoeiend, maar de Mongolen bleken machtiger toen ze uiteindelijk de stad op 1 juni 1215 innamen en de inwoners afslachtten. Dit dwong Jin-keizer Xuanzong zijn hoofdstad naar het zuiden te verplaatsen naar Kaifeng, en opende de vallei van de Gele Rivier voor verdere Mongoolse verwoestingen. Kaifeng viel ook in handen van de Mongolen na een belegering in 1232.

Na de overwinning van Genghis Khan op de Naimans in 1204 zocht de Naiman-prins Kuchlug zijn toevlucht bij de Qara Khitai. Verwelkomd door Gurkhan Yelü Zhilugu, greep Kuchlug uiteindelijk de macht door middel van een staatsgreep, regeerde indirect tot Zhilugu's dood in 1213 en nam vervolgens de directe controle over. Kuchlug was aanvankelijk een Nestoriaanse christen, maar bekeerde zich tijdens zijn opkomst onder de Qara Khitai tot het boeddhisme en startte religieuze vervolgingen tegen de moslimmeerderheid, wat leidde tot wijdverbreide onvrede.

Om de groeiende dreiging van Kuchlug het hoofd te bieden, stuurde Genghis Khan in 1218 generaal Jebe met 20.000 troepen, waaronder de schoonzoon van Genghis Khan, de Oeigoerse Barchuk, en mogelijk Arslan Khan, om Kuchlug te confronteren, terwijl Subutai een andere strijdmacht leidde tegen de Merkits. De Mongoolse strijdkrachten rukten door de bergen op naar Almaliq, waarbij Subutai zich afsplitste om de Merkits aan te vallen. Jebe ging vervolgens op pad om de Qara Khitai aan te vallen, versloeg een groot leger bij Balasagun en zorgde ervoor dat Kuchlug naar Kashgar vluchtte. Jebe's aankondiging dat er een einde kwam aan de religieuze vervolging leverde hem lokale steun op, wat leidde tot een opstand tegen Kuchlug in Kashgar. Kuchlug vluchtte maar werd gevangen genomen door jagers en geëxecuteerd door de Mongolen.

De Mongoolse overwinning op Kuchlug versterkte hun controle over het Qara Khitai-gebied, breidde hun invloed in Centraal-Azië uit en maakte de weg vrij voor verdere conflicten met het naburige Khwarazm-rijk.

Genghis Khan verzekerde zich van de controle over de oostelijke zijderoute en de aangrenzende gebieden, grenzend aan het uitgestrekte Khwarazmische rijk. De stopzetting van de handel tijdens het bewind van Kuchlug leidde tot verlangen naar hervatting ervan. Verdenkingen van de Khwarazmische kant resulteerden echter in de massamoord op een Mongoolse handelskaravaan in Otrar door gouverneur Inalchuq, een daad die, of deze nu rechtstreeks werd gesteund of genegeerd door de Khwarazmische sjah Mohammed II, de woede van Genghis Khan opwekte en leidde tot een oorlogsverklaring.

Het Khwarazmische rijk, hoewel groot, was onder Mohammed II gefragmenteerd en slecht verenigd, waardoor het kwetsbaar werd voor de mobiele oorlogstactieken van de Mongolen. Het aanvankelijke doelwit van de Mongolen was Otrar, dat, na een langdurige belegering, in 1220 viel. Genghis verdeelde vervolgens zijn troepen en leidde gelijktijdige aanvallen door de regio, wat leidde tot de snelle verovering van belangrijke steden als Bukhara en Samarkand. Mohammed II vluchtte, achtervolgd door Mongoolse generaals, tot aan zijn dood in 1220–1221.

In een opmerkelijk vertoon van mobiliteit en militaire bekwaamheid voerden de Mongoolse generaals Jebe en Subutai een aanval van 7.700 kilometer uit rond de Kaspische Zee, wat de eerste belangrijke interactie van de Mongolen met Europa markeerde. Ondertussen belegerden en veroverden de zonen van Genghis Khan de Khwarazmische hoofdstad Gurganj, terwijl Jalal al-Din, de opvolger van Mohammed, na een reeks nederlagen naar India vluchtte.

Tolui's campagne in Khorasan was opmerkelijk meedogenloos, met de vernietiging van grote steden als Nishapur, Merv en Herat, waardoor de erfenis van Genghis Khan als genadeloze veroveraar werd versterkt. Hoewel hedendaagse schattingen van het dodental door moderne wetenschappers als overdreven worden beschouwd, heeft de campagne onmiskenbaar geleid tot aanzienlijke demografische gevolgen.

Na de Mongoolse invasie van Khwarezm werd Jalal ad-Din gedwongen te vluchten naar de Hindu Kush, waar hij extra troepen begon te verzamelen om de Mongolen het hoofd te bieden. Met de komst van ruim 30.000 Afghaanse strijders. Zijn kracht bedroeg naar verluidt tussen de 30.000 en 60.000 man. Genghis Khan stuurde zijn opperrechter Shikhikhutag om Jalal al-Din op te sporen, maar gaf de beginnende generaal slechts 30.000 troepen.

Shikhikhutag was overmoedig na de aanhoudende Mongoolse successen, en hij bevond zich al snel op de achtergrond tegenover de veel talrijkere Khwarezmiaanse strijdmacht. De strijd vond plaats in een smalle vallei, die ongeschikt was voor de Mongoolse cavalerie. Jalal al-Din had boogschutters bereden, die hij beval af te stijgen en op de Mongolen te schieten. Vanwege het smalle terrein konden de Mongolen hun normale tactieken niet gebruiken. Om de Khwarezmiërs te misleiden, zette Shikhikhutag strokrijgers op reserve-remounts, wat hem misschien voor een dodelijke slag had kunnen behoeden, maar hij werd nog steeds in een nederlaag verdreven, waarbij hij meer dan de helft van zijn leger verloor.

Jalal ad-Din positioneerde zijn leger van minstens dertigduizend man in een defensieve houding tegen de Mongolen, waarbij hij één flank tegen de bergen plaatste terwijl zijn andere flank bedekt was door een rivierbocht. De aanvankelijke Mongoolse aanval die de strijd opende, werd teruggeslagen. Jalal al-Din deed een tegenaanval en doorbrak bijna het centrum van het Mongoolse leger. Genghis stuurde vervolgens een contingent van 10.000 man rond de berg om het leger van Jalal ad-Din te flankeren. Terwijl zijn leger vanuit twee richtingen werd aangevallen en in chaos stortte, vluchtte Jalal al-Din over de rivier de Indus.

In 1221 stopte Genghis Khan zijn Centraal-Aziatische campagnes, aanvankelijk van plan om viaIndia terug te keren, maar heroverwoog vanwege het ongeschikte klimaat en ongunstige voortekenen. Ondanks het overwinnen van de opstanden in Khorasan in 1222, trokken de Mongolen zich terug om overmatige uitbreiding te voorkomen, waarbij ze de Amu Darya-rivier als hun nieuwe grens vestigden. Genghis Khan concentreerde zich vervolgens op de administratieve organisatie van de veroverde gebieden en benoemde functionarissen bekend als darughachi en basqaq om de normaliteit te herstellen. Hij had ook contact met de taoïstische patriarch Changchun en verleende het taoïsme aanzienlijke privileges binnen het rijk.

Het stopzetten van de campagne wordt vaak toegeschreven aan het onvermogen van de Westelijke Xia om de Mongolen te steunen en hun daaropvolgende rebellie tegen de Mongoolse controle. Ondanks aanvankelijke pogingen tot diplomatie bereidde Genghis Khan zich bij zijn terugkeer naar Mongolië begin 1225 voor op een oorlog tegen de Westelijke Xia. De campagne begon begin 1226 en boekte snel succes met de verovering van Khara-Khoto en de systematische plundering van steden langs de Gansu. Hal. De Mongolen belegerden vervolgens Lingwu nabij de Xia-hoofdstad. Op 4 december, na het verslaan van een Xia-leger, liet Genghis Khan het beleg over aan zijn generaals en trok met Subutai naar het zuiden om verdere gebieden veilig te stellen.

De Mongolen verschenen voor het eerst in de Georgische bezittingen toen dit laatste koninkrijk nog op zijn hoogtepunt stond en het grootste deel van de Kaukasus domineerde. Het eerste contact vond plaats in het begin van de herfst van 1220, toen ongeveer 20.000 Mongolen onder leiding van Subutai en Jebe de verdreven sjah Mohammed II van de Khwarazmische dynastie achtervolgden naar de Kaspische Zee. Met toestemming van Genghis Khan trokken de twee Mongoolse generaals naar het westen op een verkenningsmissie. Ze drongen Armenië binnen, dat toen onder Georgisch gezag stond, en versloegen zo'n 10.000 Georgiërs en Armeniërs onder bevel van koning George IV "Lasha" van Georgië en zijn atabeg (leraar) en amirspasalar (opperbevelhebber) Ivane Mkhargrdzeli in de slag om Khunan. de Kotman-rivier. George raakte ernstig gewond aan de borst.

Hoewel onderworpen onder de Mongolen, weigert de Tangut-dynastie van Xi Xia militaire steun te verlenen aan de campagne tegen de Khwarzin-dynastie, maar gaat ze in plaats daarvan openlijk in opstand. Na het verslaan van de Khwarzins neemt Genghis Khan zijn leger onmiddellijk mee terug naar Xi Xia en begint aan een reeks overwinningen op de Tanguts. Na de overwinning beveelt hij de executie van de Tanguts, waarmee hij een einde maakt aan hun dynastie. Genghis beval zijn generaals om onderweg systematisch steden en garnizoenen te vernietigen.

In de winter van 1226–1227 viel Genghis Khan tijdens de jacht van zijn paard en werd steeds zieker. Zijn ziekte vertraagde de voortgang van een belegering tegen Xia. Ondanks het advies om naar huis terug te keren en te herstellen, stond hij erop door te gaan. Genghis stierf op 25 augustus 1227, maar zijn dood werd geheim gehouden. De stad Xia, zich niet bewust van zijn dood, viel de volgende maand. De bevolking leed aan ernstige wreedheden, wat leidde tot het bijna uitsterven van de Xia-beschaving. Er wordt gespeculeerd over hoe Genghis stierf. Sommige bronnen suggereren ziektes als malaria of de builenpest, terwijl anderen beweren dat hij door een pijl is neergeschoten of door de bliksem is getroffen.

Na zijn dood werd Genghis begraven nabij de Burkhan Khaldun-piek in het Khentii-gebergte, een plek die hij eerder had uitgekozen. Details van zijn begrafenis werden privé gehouden. Toen zijn zoon Ogedei in 1229 khan werd, werd het graf geëerd met offers en het offeren van dertig meisjes. Sommige theorieën suggereren dat hij mogelijk in de Ordos-regio is begraven om ontbinding te voorkomen.