सियामी र भियतनामी प्रभुत्व 17 औं र 18 औं शताब्दीको दौडान तीव्र भयो, जसको परिणामस्वरूप खमेर शाही अख्तियार एक वासलको राज्यमा घटेर सत्ताको सीटको बारम्बार विस्थापन भयो।सियाम, जसलाई अन्यथा 18 औं शताब्दीमा भियतनामी आक्रमणको बिरूद्ध सहयोगीको रूपमा प्रस्तुत गरिएको हुन सक्छ, आफैं बर्मासँग लामो संघर्षमा संलग्न थियो र 1767 मा अयुथयाको सियामको राजधानी पूर्ण रूपमा नष्ट भयो।यद्यपि, सियामले निको भयो र चाँडै कम्बोडियामा आफ्नो प्रभुत्व पुन: स्थापित गर्यो।युवा खमेर राजा आङ इङ्ग (१७७९-९६) ओउडोङमा राजाको रूपमा स्थापित भएका थिए जबकि सियामले कम्बोडियाको बाटाम्बाङ र सिम रीप प्रान्तहरू कब्जा गरे।स्थानीय शासकहरू प्रत्यक्ष सियामी शासन अन्तर्गत वासल बने।^[७२]सियाम र भियतनामको कम्बोडियासँगको सम्बन्धको बारेमा मौलिक रूपमा फरक दृष्टिकोण थियो।सियामीहरूले धेरै धार्मिक र सांस्कृतिक अभ्यासहरू अपनाएर खमेरसँग साझा धर्म, पौराणिक कथा, साहित्य र संस्कृति साझा गरे।^[७३] थाई चक्री राजाहरूले एक आदर्श सार्वभौमिक शासकको चक्रवटिन प्रणालीलाई पछ्याए, नैतिक रूपमा र उदारतापूर्वक आफ्ना सबै प्रजाहरूमा शासन गरे।भियतनामीहरूले एक सभ्यता मिशन लागू गरे, किनकि उनीहरूले खमेर मानिसहरूलाई सांस्कृतिक रूपमा निम्न स्तरको रूपमा हेरेका थिए र खमेर भूमिहरूलाई भियतनामका बसोबास गर्नेहरूद्वारा औपनिवेशिकताको लागि वैध स्थल मानेका थिए।^[७४]19 औं शताब्दीको प्रारम्भमा कम्बोडिया र मेकोङ बेसिनको नियन्त्रणको लागि सियाम र भियतनाम बीचको नयाँ संघर्षको परिणामस्वरूप कम्बोडियन वासल राजामाथि भियतनामी प्रभुत्व भयो।कम्बोडियनहरूलाई भियतनामी चलनहरू अपनाउन बाध्य पार्ने प्रयासले भियतनामी शासन विरुद्ध धेरै विद्रोहहरू निम्त्यायो।सबैभन्दा उल्लेखनीय 1840 देखि 1841 सम्म भयो, देशको धेरै भागमा फैलियो।मेकोङ डेल्टाको क्षेत्र कम्बोडियन र भियतनामी बीचको क्षेत्रीय विवाद बन्यो।कम्बोडियाले बिस्तारै मेकोङ डेल्टाको नियन्त्रण गुमायो।