Pada kematian Feodor yang tidak mempunyai anak pada 7 Januari 1598, serta khabar angin pembunuhan adik lelaki Feodor, Dimitry, menyebabkan Boris naik ke tampuk kuasa.Pemilihannya telah dicadangkan oleh Patriarch Job of Moscow, yang percaya bahawa Boris adalah satu-satunya orang yang mampu menghadapi kesukaran keadaan.Boris, bagaimanapun, akan menerima takhta hanya daripada Zemsky Sobor (perhimpunan kebangsaan), yang bermesyuarat pada 17 Februari dan sebulat suara memilihnya pada 21 Februari.Pada 1 September, beliau dinobatkan sebagai tsar.Dia mengiktiraf keperluan untuk Rusia mengejar kemajuan intelektual Barat dan melakukan yang terbaik untuk membawa pembaharuan pendidikan dan sosial.Beliau adalah tsar pertama yang mengimport guru asing secara besar-besaran, yang pertama menghantar anak muda Rusia ke luar negara untuk dididik, dan yang pertama membenarkan gereja Lutheran dibina di Rusia.