Pada tahun 1988, demokrasi telah diwujudkan semula di Pakistan dengan pilihan raya umum berikutan kematian Presiden Zia-ul-Haq.Pilihan raya ini membawa kepada kembalinya Parti Rakyat Pakistan (PPP) berkuasa, dengan Benazir Bhutto menjadi Perdana Menteri wanita pertama Pakistan dan ketua kerajaan wanita pertama di negara majoriti Muslim.Tempoh ini, yang berlangsung sehingga 1999, dicirikan oleh sistem dua parti yang kompetitif, dengan konservatif kanan tengah diketuai oleh Nawaz Sharif dan sosialis kiri tengah di bawah Benazir Bhutto.Semasa tempoh perkhidmatannya, Bhutto mengemudi Pakistan melalui peringkat akhir Perang Dingin , mengekalkan dasar pro-Barat kerana ketidakpercayaan bersama terhadap komunisme.Kerajaannya menyaksikan pengunduran tentera Soviet dari Afghanistan .Bagaimanapun, penemuan projek bom atom Pakistan membawa kepada ketegangan hubungan dengan Amerika Syarikat dan mengenakan sekatan ekonomi.Kerajaan Bhutto juga menghadapi cabaran di Afghanistan, dengan campur tangan tentera yang gagal membawa kepada pemecatan pengarah perkhidmatan perisikan.Walaupun usaha untuk memulihkan ekonomi, termasuk Rancangan Lima Tahun Ketujuh, Pakistan mengalami stagflasi, dan kerajaan Bhutto akhirnya dipecat oleh Presiden konservatif Ghulam Ishaq Khan.