Pada tahun 1947, Pakistan muncul sebagai negara baharu dengan Liaquat Ali Khan sebagai Perdana Menteri pertamanya dan Muhammad Ali Jinnah sebagai Gabenor Jeneral dan Speaker Parlimen.Jinnah, menolak tawaran Lord Mountbatten untuk menjadi Gabenor Jeneral bagi kedua-dua India dan Pakistan, memimpin negara itu sehingga kematiannya pada tahun 1948. Di bawah kepimpinannya, Pakistan mengambil langkah ke arah menjadi sebuah negara Islam, terutamanya dengan pengenalan Resolusi Objektif oleh Perdana Menteri. Khan pada tahun 1949, menekankan kedaulatan Allah.Resolusi Objektif mengisytiharkan bahawa kedaulatan ke atas seluruh alam adalah milik Allah Yang Maha Kuasa.^[5]Tahun-tahun awal Pakistan juga menyaksikan penghijrahan yang ketara dari India, khususnya ke Karachi, ^[6] ibu kota pertama.Untuk mengukuhkan infrastruktur kewangan Pakistan, Setiausaha Kewangannya Victor Turner melaksanakan dasar monetari pertama negara itu.Ini termasuk menubuhkan institusi utama seperti Bank Negara, Biro Perangkaan Persekutuan dan Lembaga Hasil Persekutuan, bertujuan untuk meningkatkan keupayaan negara dalam kewangan, percukaian dan kutipan hasil.^[7] Walau bagaimanapun, Pakistan menghadapi isu penting dengan India.Pada April 1948, India memutuskan bekalan air ke Pakistan daripada dua kerja utama terusan di Punjab, memburukkan lagi ketegangan antara kedua-dua negara.Selain itu, India pada mulanya menahan bahagian aset dan dana Pakistan daripada United India.Aset ini akhirnya dilepaskan di bawah tekanan daripada Mahatma Gandhi.^[8] Masalah wilayah timbul dengan jiran Afghanistan di sempadan Pakistan–Afghanistan pada tahun 1949, dan dengan India melalui Garis Kawalan di Kashmir.^[9]Negara itu juga mendapatkan pengiktirafan antarabangsa, dengan Iran menjadi yang pertama mengiktirafnya, tetapi menghadapi keengganan awal daripada Kesatuan Soviet dan Israel .Pakistan secara aktif mengejar kepimpinan dalam dunia Islam, bertujuan untuk menyatukan negara-negara Islam.Cita-cita ini, bagaimanapun, menghadapi keraguan di peringkat antarabangsa dan di kalangan beberapa negara Arab.Pakistan juga menyokong pelbagai gerakan kemerdekaan di dunia Islam.Di dalam negeri, dasar bahasa menjadi isu yang dipertikaikan, dengan Jinnah mengisytiharkan bahasa Urdu sebagai bahasa negeri, yang menyebabkan ketegangan di Bengal Timur.Selepas kematian Jinnah pada tahun 1948, Sir Khawaja Nazimuddin menjadi Gabenor Jeneral, meneruskan usaha pembinaan negara dalam tahun-tahun pembentukan Pakistan.