Kerajaan Lan Na berkonflik mengenai negeri-negeri Shan dengan raja Burma ekspansionis Bayinnaung.Pasukan Bayinnaung menyerang Lan Na dari utara, dan Mekuti menyerah pada 2 April 1558. ^[50] Digalakkan oleh Setthathirath, Mekuti memberontak semasa Perang Burma–Siam (1563–64).Tetapi raja itu telah ditangkap oleh tentera Burma pada November 1564, dan dihantar ke ibu kota Burma ketika itu di Pegu.Bayinnaung kemudiannya menjadikan Wisutthithewi, seorang Lan Na diraja, permaisuri kerajaan Lan Na.Selepas kematiannya, Bayinnaung melantik salah seorang anak lelakinya Nawrahta Minsaw (Noratra Minsosi), raja muda Lan Na pada Januari 1579. ^[51] Burma membenarkan tahap autonomi yang besar untuk Lan Na tetapi mengawal ketat corvée dan cukai.Menjelang 1720-an, Dinasti Toungoo berada di kaki terakhirnya.Pada tahun 1727, Chiang Mai memberontak kerana cukai yang tinggi.Pasukan penentangan menghalau tentera Burma pada 1727–1728 dan 1731–1732, selepas itu Chiang Mai dan lembah Ping merdeka.^[52] Chiang Mai menjadi anak sungai sekali lagi pada tahun 1757 kepada dinasti Burma yang baru.Ia memberontak sekali lagi pada tahun 1761 dengan dorongan Siam tetapi pemberontakan itu telah ditindas pada Januari 1763. Pada tahun 1765, orang Burma menggunakan Lan Na sebagai landasan pelancaran untuk menyerang negeri Laos, dan Siam sendiri.