Raja Hijau, Ratu Hijau, menaiki takhta Patani pada tahun 1584 kerana kekurangan waris lelaki.Dia mengakui kuasa Siam dan menerima gelaran peracau.Di bawah pemerintahannya, yang berlangsung selama 32 tahun, Patani makmur, menjadi hab kebudayaan dan pusat perdagangan yang terkemuka.Pedagang Cina, Melayu, Siam, Portugis, Jepun, Belanda, dan Inggeris sering mengunjungi Patani, menyumbang kepada pertumbuhan ekonominya.Pedagang Cina, khususnya, memainkan peranan penting dalam kebangkitan Patani sebagai pusat perdagangan, dan pedagang Eropah melihat Patani sebagai pintu masuk ke pasaran China.Selepas pemerintahan Raja Hijau, Patani diperintah oleh beberapa permaisuri, termasuk Raja Biru (Ratu Biru), Raja Ungu (Ratu Ungu), dan Raja Kuning (Ratu Kuning).Raja Biru menggabungkan Kesultanan Kelantan ke dalam Patani, manakala Raja Ungu membentuk pakatan dan menentang penguasaan Siam, yang membawa kepada konflik dengan Siam.Pemerintahan Raja Kuning menandakan kemerosotan kuasa dan pengaruh Patani.Dia berusaha untuk berdamai dengan orang Siam, tetapi pemerintahannya ditandai dengan ketidakstabilan politik dan penurunan dalam perdagangan.Menjelang pertengahan abad ke-17, kuasa permaisuri Patani telah berkurangan, dan kekacauan politik melanda wilayah itu.Raja Kuning didakwa digulingkan oleh Raja Kelantan pada tahun 1651, membawa kepada dinasti Kelantan di Patani.Wilayah ini menghadapi pemberontakan dan pencerobohan, terutamanya dari Ayutthaya.Menjelang akhir abad ke-17, pergolakan politik dan pelanggaran undang-undang tidak menggalakkan pedagang asing daripada berdagang dengan Patani, yang membawa kepada kemerosotan seperti yang diterangkan dalam sumber Cina.