Perang Saudara Hasmonean adalah konflik penting dalam sejarah Yahudi yang membawa kepada kehilangan kemerdekaan Yahudi.Ia bermula sebagai perebutan kuasa antara dua beradik, Hyrcanus dan Aristobulus, yang bersaing untuk Mahkota Yahudi Hasmonean.Aristobulus, yang lebih muda dan lebih bercita-cita tinggi daripada kedua-duanya, menggunakan hubungannya untuk mengawal kota berdinding dan mengupah tentera upahan untuk mengisytiharkan dirinya sebagai raja semasa ibu mereka, Alexandra, masih hidup.Tindakan ini mengakibatkan konfrontasi antara dua beradik itu dan tempoh persengketaan awam.Penglibatan Nabataean semakin merumitkan konflik apabila Antipater orang Idumean meyakinkan Hyrcanus untuk mendapatkan sokongan daripada Aretas III, raja Nabataean.Hyrcanus membuat perjanjian dengan Aretas, menawarkan untuk mengembalikan 12 kota kepada Nabataean sebagai pertukaran untuk bantuan ketenteraan.Dengan sokongan pasukan Nabataean, Hyrcanus menghadapi Aristobulus, yang membawa kepada pengepungan Yerusalem.Penglibatan Rom akhirnya menentukan hasil konflik.Kedua-dua Hyrcanus dan Aristobulus meminta sokongan daripada pegawai Rom, tetapi Pompey, seorang jeneral Rom, akhirnya memihak kepada Hyrcanus.Dia mengepung Baitulmuqaddis, dan selepas pertempuran yang panjang dan sengit, pasukan Pompey berjaya menembusi pertahanan kota itu, yang membawa kepada penawanan Baitulmaqdis.Peristiwa ini menandakan berakhirnya kemerdekaan dinasti Hasmonean, apabila Pompey mengembalikan Hyrcanus sebagai Imam Besar tetapi melucutkan gelaran dirajanya, mewujudkan pengaruh Rom ke atas Yudea.Yudea kekal berautonomi tetapi diwajibkan membayar ufti dan bergantung kepada pentadbiran Rom di Syria.Kerajaan itu dipotong-potong;ia terpaksa melepaskan dataran pantai, menghalang akses ke Mediterranean, serta sebahagian daripada Idumea dan Samaria.Beberapa bandar Helenistik telah diberikan autonomi untuk membentuk Dekapolis, menyebabkan negeri itu semakin berkurangan.