Kepresidenan Akbar Hashemi Rafsanjani, yang bermula pada 16 Ogos 1989, ditandai dengan tumpuan kepada liberalisasi ekonomi dan dorongan ke arah penswastaan, berbeza dengan pendekatan yang lebih dikawal oleh kerajaan pentadbiran terdahulu di Republik Islam Iran.Disifatkan sebagai "liberal dari segi ekonomi, autoritarian politik dan tradisional dari segi falsafah," pentadbiran Rafsanjani menghadapi tentangan daripada unsur-unsur radikal dalam Majles (parlimen Iran).^[114]Semasa tempoh perkhidmatannya, Rafsanjani memainkan peranan penting dalam pembinaan semula Iran selepas perang berikutan Perang Iran-Iraq.^[115] Pentadbirannya cuba mengekang kuasa ultra konservatif, tetapi usaha ini sebahagian besarnya tidak berjaya kerana Pengawal Revolusi Iran memperoleh lebih kuasa di bawah bimbingan Khamenei.Rafsanjani menghadapi dakwaan rasuah daripada puak konservatif ^[116] dan reformis, ^[117] dan jawatan presidennya terkenal dengan tindakan keras terhadap perbezaan pendapat.^[118]Selepas perang, kerajaan Rafsanjani memberi tumpuan kepada pembangunan negara.Pelan pembangunan pertama Republik Islam Iran telah dirangka di bawah pentadbirannya, bertujuan untuk memodenkan pertahanan, infrastruktur, budaya, dan ekonomi Iran.Pelan itu berusaha untuk memenuhi keperluan asas, mengubah corak penggunaan, dan menambah baik pengurusan pentadbiran dan kehakiman.Kerajaan Rafsanjani terkenal kerana mengutamakan pembangunan infrastruktur perindustrian dan pengangkutan.Di dalam negeri, Rafsanjani memperjuangkan ekonomi pasaran bebas, mengejar liberalisasi ekonomi dengan tabung negara disokong oleh hasil minyak.Beliau berhasrat untuk menyepadukan Iran ke dalam ekonomi global, menyokong dasar pelarasan struktur yang diilhamkan oleh Bank Dunia.Pendekatan ini mencari ekonomi berasaskan perindustrian moden, berbeza dengan dasar penggantinya, Mahmoud Ahmadinejad, yang memihak kepada pengagihan semula ekonomi dan pendirian tegas menentang campur tangan Barat.Rafsanjani menggalakkan kerjasama antara universiti dan industri, menekankan keperluan untuk menyesuaikan diri dengan landskap global yang berubah dengan pantas.Beliau memulakan projek seperti Universiti Azad Islam, menandakan komitmen terhadap pendidikan dan pembangunan.^[119]Tempoh Rafsanjani juga menyaksikan pelaksanaan hukuman mati terhadap pelbagai kumpulan oleh sistem kehakiman Iran, termasuk penentang politik, Komunis, Kurd, Baha'i, dan juga beberapa ulama Islam.Beliau mengambil sikap keras terhadap Pertubuhan Mojahedin Rakyat Iran, menyokong hukuman keras selaras dengan undang-undang Islam.^[120] Rafsanjani bekerja rapat dengan Khamenei untuk memastikan kestabilan kerajaan selepas kematian Khomeini.Dalam hal ehwal luar negeri, Rafsanjani berusaha memperbaiki hubungan dengan negara Arab dan meluaskan hubungan dengan negara-negara di Asia Tengah dan Caucasus.Walau bagaimanapun, hubungan dengan negara Barat, terutamanya AS, kekal tegang.Kerajaan Rafsanjani menyediakan bantuan kemanusiaan semasa Perang Teluk Parsi dan menyuarakan sokongan untuk inisiatif keamanan di Timur Tengah.Beliau juga memainkan peranan penting dalam menyokong program nuklear Iran, memastikan penggunaan teknologi nuklear Iran adalah aman.^[121]