Hun Sen dan kerajaannya telah melihat banyak kontroversi.Hun Sen ialah bekas komander Khmer Rouge yang pada asalnya ditabalkan oleh orang Vietnam dan, selepas orang Vietnam meninggalkan negara itu, mengekalkan kedudukan orang kuatnya melalui keganasan dan penindasan apabila dianggap perlu.^[101] Pada tahun 1997, kerana bimbang kuasa Perdana Menteri bersamanya yang semakin meningkat, Putera Norodom Ranariddh, Hun melancarkan rampasan kuasa, menggunakan tentera untuk membersihkan Ranariddh dan penyokongnya.Ranariddh telah digulingkan dan melarikan diri ke Paris manakala penentang Hun Sen yang lain telah ditangkap, diseksa dan ada yang dihukum mati.^[101]