फ्रँको-थाई युद्ध संपल्यानंतर थाई सरकारने तटस्थता घोषित केली.पर्ल हार्बरवरील हल्ल्याच्या काही तासांनंतर 8 डिसेंबर 1941 रोजीजपान्यांनी थायलंडवर आक्रमण केले तेव्हा जपानने थायलंड ओलांडून मलायन सीमेवर सैन्य हलवण्याचा अधिकार मागितला.थोड्याशा प्रतिकारानंतर फिबुनने जपानी मागण्या मान्य केल्या.डिसेंबर 1941 मध्ये लष्करी युतीवर स्वाक्षरी करून सरकारने जपानशी संबंध सुधारले. जपानी सैन्याने बर्मा आणि मलायावरील आक्रमणांसाठी देशाचा आधार म्हणून वापर केला.^[६३] तथापि, जपानी लोकांनी मलायामधून "सायकल ब्लिट्झक्रीग" मध्ये आश्चर्यकारकपणे थोडासा प्रतिकार केल्यावर, संकोचामुळे उत्साह वाढला.^[६४] पुढच्याच महिन्यात फिबुनने ब्रिटन आणि युनायटेड स्टेट्सविरुद्ध युद्ध घोषित केले.त्याच दिवशी दक्षिण आफ्रिका आणि न्यूझीलंडने थायलंडविरुद्ध युद्ध घोषित केले.त्यानंतर लगेच ऑस्ट्रेलियाचा क्रमांक लागतो.^[६५] जपानी युतीला विरोध करणाऱ्या सर्वांना त्याच्या सरकारमधून काढून टाकण्यात आले.अनुपस्थित राजा आनंदा महिडोल यांच्यासाठी प्रिडी फानोम्योंग यांना कार्यवाहक म्हणून नियुक्त करण्यात आले, तर डायरेक जयनामा, प्रमुख परराष्ट्र मंत्री ज्यांनी जपानी लोकांविरुद्ध सतत प्रतिकार करण्याची वकिली केली होती, त्यांना नंतर टोकियोला राजदूत म्हणून पाठवण्यात आले.युनायटेड स्टेट्सने थायलंडला जपानचे कठपुतळी मानले आणि युद्ध घोषित करण्यास नकार दिला.जेव्हा मित्रपक्ष विजयी झाले, तेव्हा युनायटेड स्टेट्सने दंडात्मक शांतता लागू करण्याच्या ब्रिटिश प्रयत्नांना रोखले.^[६६]थाई आणि जपानी लोकांनी मान्य केले की शान राज्य आणि काया राज्य थाईच्या नियंत्रणाखाली असावे.10 मे 1942 रोजी, थाई फायप आर्मीने बर्माच्या पूर्व शान राज्यात प्रवेश केला, थाई बर्मा एरिया आर्मीने काया राज्य आणि मध्य बर्माच्या काही भागात प्रवेश केला.तीन थाई पायदळ आणि एक घोडदळ विभाग, ज्याचे नेतृत्व चिलखत टोपण गटांनी केले आणि हवाई दलाने पाठबळ दिले, त्यांनी माघार घेणाऱ्या चिनी 93 व्या तुकडीला गुंतवले.केंगतुंग, मुख्य उद्देश, 27 मे रोजी पकडला गेला.जून आणि नोव्हेंबरमध्ये नूतनीकरण केलेल्या हल्ल्यांमुळे चिनी लोकांनी युनानमध्ये माघार घेतली.^[६७] शान राज्ये आणि काया राज्य असलेले क्षेत्र 1942 मध्ये थायलंडने जोडले होते. ते 1945 मध्ये बर्माला परत दिले जातील.सेरी थाई (फ्री थाई मूव्हमेंट) ही वॉशिंग्टनमधील थाई राजदूत सेनी प्रमोज यांनी स्थापन केलेली जपानविरुद्धची भूमिगत प्रतिकार चळवळ होती.थायलंडमधून रीजेंट प्रीडीच्या कार्यालयातून, हे मुक्तपणे चालवले जाते, बहुतेकदा राजघराण्यातील सदस्य जसे की प्रिन्स चुला चक्रबोंगसे आणि सरकारचे सदस्य यांच्या समर्थनाने.जसजसा जपान पराभवाच्या जवळ आला होता आणि भूमिगत जपानविरोधी प्रतिकार सेरी थाईची ताकद सातत्याने वाढत गेली, तसतसे नॅशनल असेंब्लीने फिबुनला बाहेर काढण्यास भाग पाडले.लष्करी कमांडर-इन-चीफ म्हणून त्यांची सहा वर्षांची कारकीर्द संपुष्टात आली होती.त्यांच्या दोन भव्य योजना मोडकळीस आल्याने त्यांचा राजीनामा अंशत: भाग पाडण्यात आला.एक म्हणजे बँकॉकमधून राजधानी उत्तर-मध्य थायलंडमधील फेचबून जवळच्या जंगलातील एका दुर्गम जागेवर हलवणे.दुसरे म्हणजे साराबुरीजवळ "बौद्ध शहर" वसवायचे.गंभीर आर्थिक अडचणीच्या वेळी घोषित केलेल्या या कल्पनांनी अनेक सरकारी अधिकारी त्याच्या विरोधात गेले.^[६८]युद्धाच्या शेवटी, फिबुनवर मित्र राष्ट्रांच्या आग्रहास्तव युद्धगुन्हे केल्याच्या आरोपाखाली खटला चालवला गेला, मुख्यतः अक्ष शक्तींशी सहकार्य केल्याबद्दल.मात्र, जनतेच्या तीव्र दबावामुळे त्यांची निर्दोष मुक्तता करण्यात आली.फिबुनला जनमत अजूनही अनुकूल होते, कारण त्याने थाई हितसंबंधांचे रक्षण करण्यासाठी सर्वतोपरी प्रयत्न केले होते, विशेषत: मलाया आणि बर्मामधील थाई प्रदेशाच्या विस्ताराला पाठिंबा देण्यासाठी जपानशी युती करून.^[६९]