2020 წლის მარტში, პოლიტიკური აჯანყების ფონზე, მუჰიიდინ იასინი დაინიშნა მალაიზიის მერვე პრემიერ-მინისტრად მაჰათირ მოჰამადის მოულოდნელი გადადგომის შემდეგ.ის ხელმძღვანელობდა ახალ პერიკატანის ეროვნულ კოალიციურ მთავრობას.თანამდებობის დაკავებიდან მალევე, COVID-19 პანდემია დაარტყა მალაიზიას, რამაც აიძულა მუჰიდიდინმა აღასრულოს მალაიზიის მოძრაობის კონტროლის ბრძანება (MCO) 2020 წლის მარტში მისი გავრცელების შესაჩერებლად.ამ პერიოდში ასევე ყოფილი პრემიერ-მინისტრი ნაჯიბ რაზაკი გაასამართლეს კორუფციის ბრალდებით 2020 წლის ივლისში, რაც პირველად იყო მალაიზიის პრემიერ-მინისტრის წინაშე ასეთი მსჯავრდებული.2021 წელს დამატებითი გამოწვევები მოუტანა მუჰიიდინის ადმინისტრაციას.იანვარში, Yang di-Pertuan Agong-მა გამოაცხადა ეროვნული საგანგებო მდგომარეობა, შეაჩერა საპარლამენტო სესიები და არჩევნები და მთავრობას უფლება მისცა, კანონმდებლობის დამტკიცების გარეშე მიეღო კანონები მიმდინარე პანდემიისა და პოლიტიკური არასტაბილურობის გამო.მიუხედავად ამ გამოწვევებისა, მთავრობამ თებერვალში გამოაქვეყნა COVID-19 ვაქცინაციის ეროვნული პროგრამა.თუმცა, მარტში მალაიზიასა და ჩრდილოეთ კორეას შორის დიპლომატიური ურთიერთობები გაწყდა მას შემდეგ, რაც ჩრდილოეთ კორეელი ბიზნესმენის მიმართვა აშშ-ში ექსტრადიციის შესახებ უარყო კუალა ლუმპურის უმაღლესმა სასამართლომ.2021 წლის აგვისტოსთვის გაძლიერდა პოლიტიკური და ჯანდაცვის კრიზისი, მუჰიიდინი ფართო კრიტიკის წინაშე დგას მთავრობის მიერ პანდემიასთან და ეკონომიკურ ვარდნასთან დაკავშირებით.ამან გამოიწვია ის, რომ მან პარლამენტში უმრავლესობის მხარდაჭერა დაკარგა.შესაბამისად, მუჰიიდინი პრემიერ-მინისტრის თანამდებობიდან გადადგა 2021 წლის 16 აგვისტოს. მისი გადადგომის შემდეგ, იგი დაინიშნა პრემიერ-მინისტრის მოვალეობის შემსრულებლად იან დი-პერტუან აგონგის მიერ, სანამ შესაფერისი მემკვიდრე არ აირჩევდა.