ჰასმონეს სამოქალაქო ომი იყო მნიშვნელოვანი კონფლიქტი ებრაელთა ისტორიაში, რამაც გამოიწვია ებრაელთა დამოუკიდებლობის დაკარგვა.ეს დაიწყო, როგორც ძალაუფლების ბრძოლა ორ ძმას, ჰირკანუსსა და არისტობულუსს შორის, რომლებიც იბრძოდნენ ჰასმონის ებრაული გვირგვინისთვის.არისტობულუსმა, მათგან უმცროსმა და ამბიციურმა, გამოიყენა თავისი კავშირები გალავნით შემოზღუდულ ქალაქებზე კონტროლისთვის და დაიქირავა დაქირავებული ჯარისკაცები, რათა გამოეცხადებინათ თავი მეფედ, სანამ მათი დედა, ალექსანდრა, ჯერ კიდევ ცოცხალი იყო.ამ ქმედებას მოჰყვა ორ ძმას შორის დაპირისპირება და სამოქალაქო დაპირისპირების პერიოდი.ნაბატეელთა მონაწილეობამ კიდევ უფრო გაართულა კონფლიქტი, როდესაც ანტიპატრე იდუმეელმა დაარწმუნა ჰირკანი, მიეღო მხარდაჭერა ნაბატეელთა მეფის არეტას III-ისგან.ჰირკანუსმა გარიგება დადო არეტასთან და სამხედრო დახმარების სანაცვლოდ ნაბატეელებს 12 ქალაქის დაბრუნება შესთავაზა.ნაბატეელთა ძალების მხარდაჭერით ჰირკანი დაუპირისპირდა არისტობულუსს, რამაც გამოიწვია იერუსალიმის ალყა.რომაელთა მონაწილეობამ საბოლოოდ განსაზღვრა კონფლიქტის შედეგი.ჰირკანიც და არისტობულუსიც ცდილობდნენ მხარდაჭერას რომაელი ჩინოვნიკებისგან, მაგრამ პომპეუსი, რომაელი გენერალი, საბოლოოდ ჰირკანის მხარეს დადგა.მან ალყა შემოარტყა იერუსალიმს და ხანგრძლივი და ინტენსიური ბრძოლის შემდეგ პომპეუსის ჯარებმა მოახერხეს ქალაქის თავდაცვითი ძალების გარღვევა, რამაც გამოიწვია იერუსალიმის აღება.ამ მოვლენამ დაასრულა ჰასმონელთა დინასტიის დამოუკიდებლობა, რადგან პომპეუსმა აღადგინა ჰირკანუსი მღვდელმთავრად, მაგრამ ჩამოართვა მას სამეფო ტიტული, რამაც რომაელთა გავლენა მოახდინა იუდეაზე.იუდეა დარჩა ავტონომიური, მაგრამ ვალდებული იყო გადაეხადა ხარკი და დამოკიდებული იყო რომის ადმინისტრაციაზე სირიაში.დაიშალა სამეფო;იგი იძულებული გახდა დაეტოვებინა სანაპირო დაბლობი, ჩამოერთვა მას ხმელთაშუა ზღვაზე, ასევე იდუმეისა და სამარიის ნაწილებზე.რამდენიმე ელინისტურ ქალაქს მიენიჭა ავტონომია დეკაპოლისის შესაქმნელად, რის გამოც სახელმწიფო მნიშვნელოვნად შემცირდა.