彼の王朝の 3 番目で最後の王であるヨハネ 2 世カシミール ヴァーサ (在位 1648 ～ 1668 年) の治世中、外国からの侵略と国内の混乱の結果、貴族の民主主義は衰退しました。これらの災害は突然増大し、ポーランドの黄金時代の終わりを告げました。その影響は、かつて強力だった連邦を外国の介入に対してますます脆弱にすることでした。1648 年から 1657 年にかけて起きたコサックのフメリニツキー蜂起は、ポーランド王冠の南東部地域を巻き込みました。その長期的な影響は連邦にとって悲惨なものでした。最初のリベルム拒否権（セイムのメンバーが現在の会期を直ちに解散できるようにする議会の手段）は、1652 年に代議員によって行使されました。この慣行は、最終的にポーランドの中央政府を決定的に弱体化させることになりました。ペレヤスラフ条約 (1654 年) で、ウクライナの反乱軍は自らをロシア皇帝国の臣民であると宣言しました。第二次北方戦争は 1655 年から 1660 年にかけてポーランド中核地域で激化しました。その中にはスウェーデン大洪水と呼ばれる残忍で壊滅的なポーランド侵攻も含まれていました。戦争中、連邦はスウェーデンとロシアによる侵略により、人口の約3分の1を失い、大国としての地位も失った。ワルシャワ王城の管理者であるアンジェイ・ロッテルムント教授によると、大洪水によるポーランドの破壊は第二次世界大戦での国の破壊よりも広範囲に及んだという。ロッテルムントは、スウェーデンの侵略者がイギリス連邦から最も重要な富を奪い、盗まれた品物のほとんどはポーランドに戻らなかったと主張している。ポーランド・リトアニア連邦の首都ワルシャワはスウェーデン人によって破壊され、戦前の人口2万人のうち、戦後も市内に残ったのはわずか2千人だった。戦争は 1660 年にオリバ条約で終結し、その結果ポーランド北部の領土の一部が失われました。クリミア・タタール人に対する大規模な奴隷襲撃もポーランド経済に極めて悪影響を及ぼした。ポーランド初の新聞であるメルクリウス・ポルスキは 1661 年に発行されました。