ミカエル9世パレオロゴスは、1294年から亡くなるまで、父アンドロニコス2世パレオロゴスとともにビザンチン皇帝を務めました。アンドロニコス2世とミカエル9世は平等な共同統治者として統治し、どちらもオートクラトルの称号を使用した。軍事的威信にもかかわらず、彼はいくつかの敗北を喫したが、その理由は不明瞭だった。指揮官としての無能さ、ビザンチン軍の悲惨な状況、あるいは単に不運だったからである。父親に先立って亡くなった唯一のパレオロゴス皇帝であり、43歳で早逝したのは、長男で後の共同皇帝アンドロニコス3世パレオロゴスの家臣らによる次男マヌエル・パレオロゴスの誤った殺害に対する悲しみの一因であると考えられている。