গ্রীকরা 1460 সাল পর্যন্ত পেলোপনিসে আবদ্ধ ছিল, এবং ভেনিশিয়ান এবং জেনোস কিছু দ্বীপের সাথে আঁকড়ে ধরেছিল, কিন্তু 16 শতকের গোড়ার দিকে সমস্ত মূল ভূখণ্ড গ্রীস এবং বেশিরভাগ এজিয়ান দ্বীপগুলি অটোমান সাম্রাজ্য দ্বারা উপনিবেশিত হয়েছিল, এখনও বেশ কয়েকটি বন্দর শহর বাদে। ভেনিসিয়ানদের দ্বারা অনুষ্ঠিত (নাফপ্লিও, মোনেমভাসিয়া, পারগা এবং মিথোন তাদের মধ্যে সবচেয়ে গুরুত্বপূর্ণ)।সাইক্লেডস দ্বীপপুঞ্জ, এজিয়ানের মাঝখানে, আনুষ্ঠানিকভাবে 1579 সালে অটোমানদের দ্বারা সংযুক্ত করা হয়েছিল, যদিও তারা 1530 সাল থেকে ভাসাল মর্যাদার অধীনে ছিল।1571 সালে সাইপ্রাসের পতন ঘটে এবং ভেনিসিয়ানরা 1669 সাল পর্যন্ত ক্রিটকে ধরে রাখে। কেফালোনিয়া (1479 থেকে 1481 এবং 1485 থেকে 1500 সাল পর্যন্ত) বাদ দিয়ে আয়োনিয়ান দ্বীপপুঞ্জ কখনই অটোমানদের দ্বারা শাসিত হয়নি এবং ভেনিস প্রজাতন্ত্রের অধীনে ছিল। .এটি আইওনিয়ান দ্বীপপুঞ্জে যেখানে আধুনিক গ্রীক রাষ্ট্রের জন্ম হয়েছিল, 1800 সালে সেভেন দ্বীপপুঞ্জের প্রজাতন্ত্রের সৃষ্টি হয়েছিল।অটোমান গ্রীস একটি বহুজাতিক সমাজ ছিল।যাইহোক, বহুসংস্কৃতিবাদের আধুনিক পশ্চিমা ধারণা, যদিও প্রথম নজরে বাজরা পদ্ধতির সাথে সামঞ্জস্যপূর্ণ বলে মনে হয়, অটোমান সিস্টেমের সাথে বেমানান বলে মনে করা হয়।একদিকে গ্রীকদের কিছু সুবিধা এবং স্বাধীনতা দেওয়া হয়েছিল;অন্যটির সাথে তারা প্রশাসনিক কর্মীদের অসদাচরণ থেকে উদ্ভূত একটি অত্যাচারের মুখোমুখি হয়েছিল যার উপর কেন্দ্রীয় সরকারের কেবল দূরবর্তী এবং অসম্পূর্ণ নিয়ন্ত্রণ ছিল।অটোমানরা যখন আসে, তখন দুটি গ্রিক অভিবাসন ঘটে।প্রথম অভিবাসন গ্রীক বুদ্ধিজীবীদের পশ্চিম ইউরোপে অভিবাসন এবং রেনেসাঁর আবির্ভাবেকে প্রভাবিত করে।দ্বিতীয় অভিবাসনের জন্য গ্রীকদের গ্রীক উপদ্বীপের সমভূমি ছেড়ে পাহাড়ে পুনর্বাসন করা হয়েছিল।অটোমান সাম্রাজ্যের বিভিন্ন জনগোষ্ঠীকে ধর্মের ভিত্তিতে আলাদা করে অর্থোডক্স গ্রীকদের জাতিগত সংহতিতে বাজরা প্রথা অবদান রেখেছিল।উসমানীয় শাসনের সময় সমভূমিতে বসবাসকারী গ্রীকরা হয় খ্রিস্টান যারা বিদেশী শাসনের বোঝা মোকাবেলা করত অথবা ক্রিপ্টো-খ্রিস্টানরা (গ্রীক মুসলিম যারা গ্রীক অর্থোডক্স বিশ্বাসের গোপন অনুশীলনকারী ছিল)।কিছু গ্রীক ভারী কর এড়াতে ক্রিপ্টো-খ্রিস্টান হয়ে ওঠে এবং একই সাথে গ্রীক অর্থোডক্স চার্চের সাথে তাদের সম্পর্ক বজায় রেখে তাদের পরিচয় প্রকাশ করে।যাইহোক, গ্রীকরা যারা ইসলামে ধর্মান্তরিত হয়েছিল এবং ক্রিপ্টো-খ্রিস্টান ছিল না তারা অর্থোডক্স গ্রীকদের চোখে "তুর্কি" (মুসলিম) বলে বিবেচিত হয়েছিল, এমনকি তারা তুর্কি ভাষা গ্রহণ না করলেও।19 শতকের গোড়ার দিকে অটোমানরা গ্রীসের বেশিরভাগ অংশ শাসন করেছিল।প্রথম স্ব-শাসিত, মধ্যযুগ থেকে, হেলেনিক রাষ্ট্র প্রতিষ্ঠিত হয়েছিল ফরাসি বিপ্লবী যুদ্ধের সময়, 1800 সালে, গ্রীসের মূল ভূখণ্ডে গ্রীক বিপ্লবের প্রাদুর্ভাবের 21 বছর আগে।এটি ছিল সেপ্টিনসুলার রিপাবলিক যার রাজধানী ছিল কর্ফু।