হুন সেন এবং তার সরকার অনেক বিতর্ক দেখেছে।হুন সেন ছিলেন একজন প্রাক্তন খেমার রুজ কমান্ডার যিনি মূলত ভিয়েতনামের দ্বারা প্রতিষ্ঠিত হয়েছিল এবং ভিয়েতনামিরা দেশ ছেড়ে যাওয়ার পর, প্রয়োজন মনে হলে সহিংসতা ও নিপীড়নের মাধ্যমে তার শক্তিশালী ব্যক্তিত্ব বজায় রাখে।^[১০১] 1997 সালে, তার সহ-প্রধানমন্ত্রী, প্রিন্স নরোদম রণরিদ্ধের ক্রমবর্ধমান ক্ষমতার ভয়ে, হুন একটি অভ্যুত্থান শুরু করে, সেনাবাহিনীকে ব্যবহার করে রণরিদ্ধ এবং তার সমর্থকদের নির্মূল করে।রণরিদ্ধকে ক্ষমতাচ্যুত করা হয় এবং প্যারিসে পালিয়ে যায় যখন হুন সেনের অন্যান্য বিরোধীদের গ্রেপ্তার করা হয়, নির্যাতন করা হয় এবং কিছুকে সংক্ষেপে মৃত্যুদণ্ড দেওয়া হয়।^[১০১]