মাইকেল IX Palaiologos 1294 সাল থেকে তার মৃত্যুর আগ পর্যন্ত তার পিতা আন্দ্রোনিকোস II Palaiologos এর সাথে বাইজেন্টাইন সম্রাট ছিলেন।অ্যান্ড্রোনিকোস II এবং মাইকেল IX সমান সহ-শাসক হিসাবে শাসন করেছিলেন, উভয়ই অটোক্রেটর শিরোনাম ব্যবহার করে।তার সামরিক প্রতিপত্তি থাকা সত্ত্বেও, তিনি অস্পষ্ট কারণে বেশ কয়েকটি পরাজয়ের সম্মুখীন হন: একজন সেনাপতি হিসাবে তার অক্ষমতা, বাইজেন্টাইন সেনাবাহিনীর শোচনীয় অবস্থা বা কেবলমাত্র দুর্ভাগ্য।একমাত্র প্যালিওলোগান সম্রাট যিনি তার পিতার পূর্বে মৃত্যুবরণ করেন, 43 বছর বয়সে তার অকাল মৃত্যু তার বড় ছেলে এবং পরবর্তী সহ-সম্রাট অ্যান্ড্রোনিকোস III পালাইওলোগোসের অনুচরদের দ্বারা তার ছোট ছেলে ম্যানুয়েল পালাইওলোগোসের দুর্ঘটনাজনিত হত্যার জন্য শোকের জন্য দায়ী করা হয়েছিল।