У 1999 годзе ў Пакістане адбыўся бяскроўны ваенны пераварот пад кіраўніцтвам генерала Первеза Мушарафа і ваеннага штаба штаба Аб'яднанага штаба.12 кастрычніка яны захапілі кантроль у грамадзянскага ўрада прэм'ер-міністра Наваза Шарыфа.Праз два дні Мушараф, як кіраўнік выканаўчай улады, спрэчна прыпыніў дзеянне Канстытуцыі Пакістана.Пераварот быў абумоўлены эскалацыяй напружанасці паміж адміністрацыяй Шарыфа і вайскоўцамі, асабліва з генералам Мушарафам.Спроба Шарыфа замяніць Мушарафа на генерал-лейтэнанта Зіяудзіна Бата на пасадзе камандуючага арміяй сутыкнулася з супрацівам высокапастаўленых ваенных чыноўнікаў і прывяла да затрымання Бата.Выкананне дзяржаўнага перавароту было хуткім.На працягу 17 гадзін вайсковыя камандзіры захапілі ключавыя дзяржаўныя ўстановы, змясціўшы Шарыфа і яго адміністрацыю, у тым ліку яго брата, пад хатні арышт.Вайскоўцы таксама ўзялі пад кантроль важную інфраструктуру сувязі.Вярхоўны суд Пакістана на чале з галоўным суддзёй Іршадам Хасанам Ханам зацвердзіў ваеннае становішча ў адпаведнасці з «дактрынай неабходнасці», але абмежаваў яго працягласць трыма гадамі.Шарыф быў судзімы і асуджаны за пагрозу жыццю на борце самалёта з Мушарафам, рашэнне, якое выклікала спрэчкі.У снежні 2000 года Мушараф нечакана памілаваў Шарыфа, які затым вылецеў у Саудаўскую Аравію.У 2001 годзе Мушараф стаў прэзідэнтам пасля таго, як прымусіў прэзідэнта Рафіка Тарара сысці ў адстаўку.Нацыянальны рэферэндум у красавіку 2002 г., які многія крытыкавалі як фальшывы, падоўжыў праўленне Мушарафа.Усеагульныя выбары 2002 г. адзначылі вяртанне да дэмакратыі, калі PML(Q) Мушарафа сфармавала ўрад меншасці.