Султанат Перак быў заснаваны ў пачатку 16-га стагоддзя на берагах ракі Перак Музафар-шахам I, старэйшым сынам Махмуд-шаха, 8-га султана Малакі.Пасля захопу Малакі партугальцамі ў 1511 годзе Музафар-шах шукаў прытулку ў Сіаку на Суматры, перш чым узысці на трон у Пераку.Яго стварэнню Перакскага султаната спрыялі мясцовыя лідэры, у тым ліку Тун Сабан.Пры новым султанаце адміністрацыя Перака стала больш арганізаванай, абапіраючыся на феадальную сістэму, якая практыкавалася ў дэмакратычнай Малацы.У 16 стагоддзі Перак стаў важнай крыніцай алавянай руды, прыцягваючы рэгіянальных і міжнародных гандляроў.Аднак уздым султаната прыцягнуў увагу магутнага султаната Ачэх , што прывяло да перыяду напружанасці і ўзаемадзеяння.На працягу 1570-х гадоў Ачэх настойліва нападаў на Малайскі паўвостраў.Да канца 1570-х гадоў уплыў Ачэха стаў відавочным, калі султан Перака Мансур Шах I таямніча знік, падаграваючы здагадкі аб яго выкраданні сіламі Ачэна.Гэта прывяло да таго, што сям'я султана была вывезена ў палон на Суматру.У выніку Перак ненадоўга знаходзіўся пад уладай Ачэна, калі ачэнскі прынц узышоў на трон Перака як султан Ахмад Таджуддзін Шах.Тым не менш, нягледзячы на ​​ўплыў Ачэха, Перак заставаўся аўтаномным, супраціўляючыся кантролю як з боку ачэнцаў, так і з сіямцаў.Улада Ачэха над Перакам пачала змяншацца з прыбыццём Галандскай Ост-Індскай кампаніі (VOC) у сярэдзіне 17-га стагоддзя.Ачэх і VOC змагаліся за кантроль над прыбытковым гандлем волава Перака.Да 1653 г. яны дасягнулі кампрамісу, падпісаўшы дамову, якая давала галандцам выключныя правы на волава Перака.Да канца 17-га стагоддзя, з заняпадам Джахор-султаната, Перак стаў апошнім спадчыннікам малаканскага роду, але ён сутыкнуўся з унутранымі канфліктамі, у тым ліку 40-гадовай грамадзянскай вайной у 18-м стагоддзі за даходы ад волава.Гэтыя хваляванні завяршыліся дагаворам 1747 г. з галандцамі, які прызнаваў іх манаполію на гандаль волава.