Апошні султан малаканскай дынастыі, султан Махмуд Шах II, быў вядомы сваімі бязладнымі паводзінамі, якія ў значнай ступені заставаліся бескантрольнымі пасля смерці Бендэхары Хабіба і наступнага прызначэння Бендахары Абдул Джаліля.Гэтыя паводзіны завяршыліся тым, што султан загадаў пакараць смерцю цяжарную жонку шляхціца за нязначнае парушэнне.У адплату султан быў забіты пацярпелым дваранінам, у выніку чаго трон застаўся вакантным у 1699 г. Аранг Каяс, дарадцы султана, звярнуліся да Са Акара Дыраджы, раджы Тэменгонга з Муара, які прапанаваў, каб Бендахара Абдул Джаліль успадкаваў трон.Аднак пераемнасць была сустрэта з некаторым незадавальненнем, асабліва з боку Аранга Лаута.У гэты перыяд нестабільнасці дзве дамінуючыя групы ў Джахоры — бугі і мінангкабаў — убачылі магчымасць валодаць уладай.Мінангкабау прадставіў раджу Кесіла, прынца, які сцвярджаў, што ён пасмяротны сын султана Махмуда II.Абяцаўшы багацце і ўладу, Багі першапачаткова падтрымалі Раджу Кесіла.Аднак Раджа Кесіл здрадзіў ім і каранаваў сябе султанам Джахора без іх згоды, у выніку чаго папярэдні султан Абдул Джаліль IV збег і ў канчатковым выніку быў забіты.У адплату Бугі аб'ядналіся з Раджай Сулейманам, сынам султана Абдула Джаліля IV, што прывяло да зрынення Раджы Кесіла з трона ў 1722 годзе. У той час як Раджа Сулейман стаў султанам, ён трапіў пад моцны ўплыў Бугі, якія, па сутнасці, кіравалі Джахорам.На працягу ўсяго праўлення султана Сулеймана Бадрул Алам Шаха ў сярэдзіне XVIII стагоддзя Бугі аказвалі значны кантроль над адміністрацыяй Джахора.Іх уплыў узрос настолькі значным, што да 1760 г. розныя сем'і Бугі ўступілі ў шлюб з каралеўскай лініяй Джахора, яшчэ больш умацаваўшы сваё панаванне.Пад іх кіраўніцтвам Джахор перажыў эканамічны рост, падмацаваны інтэграцыяй кітайскіх гандляроў.Аднак да канца XVIII стагоддзя Энгкау Муда з фракцыі Тэменгонга пачаў вяртаць сабе ўладу, заклаўшы аснову для будучага росквіту султаната пад кіраўніцтвам Тэменгонга Абдула Рахмана і яго нашчадкаў.