Паміж 1258 і 1291 гадамі рэгіён сутыкнуўся з узрушэннямі як мяжа паміж мангольскімі захопнікамі , часам у саюзе з крыжакамі , імамлюкаміЕгіпта .Гэты канфлікт прывёў да значнага скарачэння насельніцтва і эканамічных цяжкасцей.Мамлюкі былі ў асноўным турэцкага паходжання, іх куплялі ў дзяцінстве, а потым навучалі вайне.Гэта былі вельмі шанаваныя воіны, якія давалі ўладарам незалежнасць ад карэннай арыстакратыі.У Егіпце яны ўзялі пад свой кантроль каралеўства пасля няўдалага ўварвання крыжакоў (Сёмы крыжовы паход).Мамлюкі ўзялі пад свой кантроль Егіпет і пашырылі сваю ўладу на Палестыну.Першы мамлюкскі султан Кутуз перамог манголаў у бітве пры Айн-Джалуце, але быў забіты Бейбарсам, які змяніў яго і ліквідаваў большасць фарпостаў крыжакоў.Мамлюкі кіравалі Палестынай да 1516 года, лічачы яе часткай Сірыі.У Хэўроне яўрэі сутыкнуліся з абмежаваннямі ў Пячоры Патрыярхаў, значным месцам у юдаізме, абмежаваннем, якое захоўвалася да Шасцідзённай вайны.^[146]Аль-Ашраф Халіл, мамлюкскі султан, захапіў апошнюю крэпасць крыжакоў у 1291 г. Мамлюкі, працягваючы палітыку Аюбідаў, стратэгічна знішчылі прыбярэжныя рэгіёны ад Тыра да Газы, каб прадухіліць патэнцыйныя марскія атакі крыжакоў.Гэта спусташэнне прывяло да доўгатэрміновай дэпапуляцыі і эканамічнага заняпаду ў гэтых раёнах.^[147]Габрэйская абшчына ў Палестыне адчула амаладжэнне з прытокам сефардскіх яўрэяў пасля іх выгнання зІспаніі ў 1492 г. і пераследу ў Партугаліі ў 1497 г. Пад уладай мамлюкаў, а пазней і асманскай улады, гэтыя сефардскія яўрэі пераважна сяліліся ў гарадскіх раёнах, такіх як Цфат і Ерусалім, у адрозненне ад пераважна сельская габрэйская суполка Мустаарбі.^[148]