
Huayna Capac کی موت، ممکنہ طور پر چیچک سے ہوئی (ایک وبا ہسپانوی کے متعارف ہونے کے فوراً بعد نئی دنیا میں پھیل گئی تھی)۔ تباہ کن طور پر، Huayna Capac اپنی موت سے پہلے کسی وارث کا نام دینے میں ناکام رہی تھی۔ اس کے دو بیٹوں Huáscar اور Atahualpa کے درمیان آنے والی اقتدار کی کشمکش بالآخر خانہ جنگی کی طرف لے جاتی ہے۔ Huascar Cusco میں شرافت کی حمایت سے تخت سنبھالتا ہے۔ دریں اثنا، Atahualpa، جو ایک زیادہ قابل منتظم اور جنگجو سمجھا جاتا تھا، کو Quito میں Sapa Inca کا تاج پہنایا جاتا ہے۔ یہ معلوم نہیں ہے کہ خانہ جنگی کے دوران کتنے انکا مارے گئے یا ہلاک ہوئے۔ انکا سلطنت کی ایک وبا (ممکنہ طور پر یورپی بیماری) اور ہسپانوی فتح سے پہلے کی تخمینہ شدہ آبادی کا تخمینہ 6 سے 14 ملین کے درمیان ہے۔ خانہ جنگی، ایک وبا، اور ہسپانوی فتح کے نتیجے میں کئی دہائیوں میں آبادی میں کمی کا تخمینہ 20:1 یا 25:1 لگایا گیا، یعنی آبادی میں 95 فیصد کمی واقع ہوئی۔