
Ekber artık Hindistan'daki Afgan kalıntılarının çoğunu yenmişti. Afgan gücünün tek merkezi artık Bengal'deydi; ailesi Şer Şah Suri'nin emrinde hizmet etmiş Afgan reisi Süleyman Han Karrani'nin iktidarda olduğu yerdi. Fetih yolunda ilk önemli adım, 1574'te Ekber'in Bengal'i yöneten Afgan reislerini bastırmak için ordusunu göndermesiyle atıldı. Belirleyici savaş, 1575 yılında Babür güçlerinin galip geldiği ve bölgedeki Babür egemenliğinin temellerini attığı Tukaroi'de gerçekleşti. Daha sonraki askeri kampanyalar, Babür kontrolünü daha da güçlendirdi ve 1576'da Bengal Sultanlığı'nın güçlerini kesin bir şekilde yenilgiye uğratan Rajmahal Savaşı ile sonuçlandı.
Askeri fethin ardından Ekber, Bengal'i Babür idari çerçevesine entegre etmek için idari reformlar uyguladı. Arazi gelir sistemleri yeniden düzenlendi ve yerel yönetim yapıları Babür uygulamalarıyla uyumlu hale getirilerek kaynakların etkin kontrolü ve çıkarılması sağlandı. Fetih aynı zamanda kültürel ve ekonomik alışverişi de kolaylaştırdı, Babür İmparatorluğu'nun kültürel dokusunu zenginleştirdi ve ekonomisini güçlendirdi.
Bengal'in Babür fethi, bölgenin tarihini önemli ölçüde etkiledi ve Babür himayesi altında bir istikrar, refah ve mimari gelişme dönemini başlattı. Ekber Şah'ın saltanatının çok ötesinde bölgenin sosyo-ekonomik ve kültürel manzarasını etkileyen kalıcı bir miras oluşturdu.