Султанат Перак основао је почетком 16. века на обалама реке Перак Музафар Шах И, најстарији син Махмуд Шаха, 8. султана Малаке.Након заробљавања Малаке од стране Португалаца 1511. године, Музафар Шах је потражио уточиште у Сиаку, на Суматри, пре него што је ступио на престо у Пераку.Његово успостављање султаната Перак помогли су локални лидери, укључујући Тун Шабана.Под новим султанатом, Перакова управа је постала организованија, ослањајући се на феудални систем који се практиковао у демократској Малаки.Како је 16. век напредовао, Перак је постао суштински извор руде калаја, привлачећи регионалне и међународне трговце.Међутим, успон султаната привукао је пажњу моћног Султаната Ацех , што је довело до периода тензија и интеракција.Током 1570-их, Ацех је упорно узнемиравао делове Малајског полуострва.До касних 1570-их, Ачехов утицај је био очигледан када је Пераков султан Мансур Шах И мистериозно нестао, што је подстакло спекулације о његовој отмици од стране ачехских снага.То је довело до тога да је султанова породица заробљена на Суматру.Као резултат тога, Перак је накратко био под влашћу Ацеха када је један Ацехински принц попео на трон Перака као султан Ахмад Тајуддин Шах.Ипак, упркос Ацеховом утицају, Перак је остао аутономан, опирући се контроли и Ацехана и Сијамаца.Ацехов стисак на Перака почео је да се смањује са доласком Холандске источноиндијске компаније (ВОЦ) средином 17. века.Ацех и ВОЦ су се борили за контролу над Пераковом уносном трговином калајем.До 1653. године постигли су компромис, потписавши уговор којим су Холанђанима дала ексклузивна права на Пераков лим.До краја 17. века, са пропадањем султаната Џохор, Перак се појавио као последњи наследник Малаканске лозе, али се суочио са унутрашњим сукобима, укључујући 40-годишњи грађански рат у 18. веку због прихода од калаја.Ови немири су кулминирали споразумом из 1747. са Холанђанима, којим је признат њихов монопол над трговином калајем.