Крајем 11. века, династија Хваразмија преузела је контролу над Ираком.Овај период турске секуларне владавине и Абасидског калифата завршен је инвазијама Монгола у 13. веку.^[51] Монголи, предвођени Џингис-каном, освојили су Варезмију до 1221. Међутим, Ирак је доживео привремени одмор због Џингис-канове смрти 1227. и каснијих борби за власт унутар Монголског царства.Монгке Кан је из 1251. поново покренуо монголску експанзију, а када је калиф ал-Мустасим одбио монголске захтеве, Багдад се суочио са опсадом коју је водио Хулагу кан 1258. године.Опсада Багдада, кључни догађај у монголским освајањима, трајала је 13 дана од 29. јануара до 10. фебруара 1258. Монголске снаге Илканата , заједно са својим савезницима, опколиле су, заузеле и на крају опљачкале Багдад, главни град Абасидског калифата у то време .Ова опсада је резултирала масакром већине становника града, потенцијално бројећи стотине хиљада.Размере уништења градских библиотека и њиховог вредног садржаја и даље су тема дебате међу историчарима.Монголске снаге су погубиле Ал-Муста'сима и нанеле озбиљну депопулацију и пустошење Багдада.Ова опсада је симболично означила крај исламског златног доба, периода током којег су калифи проширили своју власт од Иберијског полуострва до Синда.