После падения Империи инков многие аспекты культуры инков были систематически уничтожены, в том числе их сложная система земледелия, известная как модель сельского хозяйства вертикального архипелага.Испанские колониальные чиновники использовали систему барщинного труда инков mita в колониальных целях, иногда жестоко.Один член каждой семьи был вынужден работать на золотых и серебряных рудниках, главным из которых был титанический серебряный рудник в Потоси.Когда член семьи умирал, что обычно происходило в течение года или двух, семья должна была прислать ему замену.Последствия оспы для империи инков были еще более разрушительными.Начавшись в Колумбии, оспа быстро распространилась до того, как испанские захватчики впервые прибыли в империю.Распространению, вероятно, способствовала эффективная система дорог инков.Оспа была только первой эпидемией.Другие болезни, в том числе возможная вспышка сыпного тифа в 1546 году, грипп и оспа вместе в 1558 году, снова оспа в 1589 году, дифтерия в 1614 году и корь в 1618 году, все опустошали народ инков.Лидеры коренных народов периодически предпринимали попытки изгнать испанских колонистов и воссоздать Империю инков до конца 18 века.