Până în 1837, tensiunile au crescut din nou în stepa kazahă. De data aceasta, tensiunile au fost declanșate de co-conducătorii kazahi Ğubaidullah Khan, Sher Ghazi Khan și Kenesary Khan, toți fiind fiii lui Qasim Sultan și nepoții lui Abu'l-Mansur Khan. Au lansat o rebeliune împotriva Rusiei. Cei trei co-conducători au vrut să restabilească independența relativă care era prezentă sub conducătorii foștilor kazahi, cum ar fi Abu'l-Mansur, și au căutat să reziste impozitării rușilor.
În 1841, cei trei hani au obținut ajutorul vărului lor mai tânăr Aziz id-Din Bahadur, fiul comandantului kazah Nasrullah Nauryzbai Bahadur și au adunat o mare trupă de kazahi bine pregătiți pentru a rezista armatei ruse. Kazahzii au capturat o serie de cetăți Kokand din Kazahstan , inclusiv fosta lor capitală Hazrat-e-Turkistan. Ei au decis să se ascundă în regiunea muntoasă din apropierea lacului Balkhash, dar au fost luați prin surprindere când un han kârgâz pe nume Ormon Khan a dezvăluit trupele ruse unde se aflau. Gubaidullah, Sher Ghazi și Kenesary au fost capturați și executați de către dezertorii kârgâzilor care îi ajutaseră pe ruși. Până la sfârșitul anului 1847, armata rusă a capturat capitalele kazahe Hazrat-e-Turkistan și Syghanaq, abolind Hanatul kazah în ansamblu.