
În anii 1380, Timur, cunoscut și sub numele de Tamerlan , și-a extins vastul imperiu eurasiatic în Azerbaidjan, integrându-l ca parte a domeniului său expansiv. Această perioadă a marcat o activitate militară și politică semnificativă, conducătorii locali, cum ar fi Ibrahim I de Shirvan, devenind vasali ai lui Timur. Ibrahim I l-a ajutat în special pe Timur în campaniile sale militare împotriva lui Tokhtamysh al Hoardei de Aur , împletind și mai mult soarta Azerbaidjanului cu cuceririle timuride.
Epoca a fost, de asemenea, caracterizată de tulburări sociale considerabile și lupte religioase, alimentate de apariția și răspândirea diferitelor mișcări religioase precum Hurufismul și Ordinul Bektashi. Aceste mișcări au dus adesea la conflicte sectare, afectând profund structura societală a Azerbaidjanului.
După moartea lui Timur în 1405, imperiul său a fost moștenit de fiul său Shah Rukh, care a domnit până în 1447. Domnia lui Shah Rukh a văzut stabilizarea domeniilor timuride într-o oarecare măsură, dar la moartea sa, regiunea a asistat la ascensiunea a două dinastii turcice rivale. la vest de fostele teritorii timuride. Qara Qoyunlu, cu sediul în jurul lacului Van, și Aq Qoyunlu, centrat în jurul Diyarbakır, au apărut ca puteri semnificative în regiune. Aceste dinastii, fiecare cu propriile teritorii și ambiții, au marcat fragmentarea autorității în zonă și au pus bazele viitoarelor conflicte și realinieri în Azerbaidjan și regiunile învecinate.