
Războaiele ruso-persane (1804-1813 și 1826-1828) au fost esențiale în remodelarea granițelor politice ale Caucazului. Tratatul de la Gulistan (1813) și Tratatul de la Turkmenchay (1828) au dus la pierderi teritoriale semnificative pentru Iran. Aceste tratate au cedat Daghestanul, Georgia și o mare parte din ceea ce este acum Azerbaidjan Imperiului Rus . Tratatele au stabilit, de asemenea, granițele moderne dintre Azerbaidjan și Iran și au redus semnificativ influența iraniană în Caucaz.
Anexarea Rusiei a transformat guvernarea regiunii. Hanatele tradiționale precum Baku și Ganja au fost fie abolite, fie aduse sub patronajul rusesc. Administrația rusă a reorganizat aceste teritorii în noi provincii, care mai târziu au format cea mai mare parte a Azerbaidjanului actual. Această reorganizare a inclus înființarea de noi districte administrative, cum ar fi Elisavetpol (acum Ganja) și districtul Shamakhi.
Tranziția de la dominația iraniană la cea rusă a determinat, de asemenea, schimbări culturale și sociale semnificative. În ciuda impunerii legii și sistemelor administrative rusești, influența culturală iraniană a rămas puternică în cercurile intelectuale musulmane din orașe precum Baku, Ganja și Tbilisi de-a lungul secolului al XIX-lea. În această perioadă, o identitate națională azeră a început să se unească, influențată atât de trecutul persan al regiunii, cât și de noul cadru politic rus.
Descoperirea petrolului la Baku la sfârșitul secolului al XIX-lea a transformat Azerbaidjanul într-o zonă industrială și economică majoră în cadrul Imperiului Rus. Boom-ul petrolului a atras investiții străine și a dus la o dezvoltare economică rapidă. Cu toate acestea, a creat și disparități mari între capitaliștii în mare parte europeni și forța de muncă musulmană locală. Această perioadă a cunoscut o dezvoltare semnificativă a infrastructurii, inclusiv înființarea de căi ferate și linii de telecomunicații care au integrat în continuare Azerbaidjanul în sfera economică rusă.