
Quando Kearny partiu com suas forças para a Califórnia, ele deixou o coronel Sterling Price no comando das forças dos EUA no Novo México. Ele nomeou Charles Bent como o primeiro governador territorial do Novo México. Uma questão mais significativa do que os irritantes insultos diários era que muitos cidadãos do Novo México temiam que os seus títulos de terra, emitidos pelo governo mexicano, não fossem reconhecidos pelos Estados Unidos. Eles temiam que os simpatizantes americanos prosperassem às suas custas. Após a partida de Kearny, dissidentes em Santa Fé planejaram um levante de Natal. Quando os planos foram descobertos pelas autoridades dos EUA, os dissidentes adiaram a revolta. Eles atraíram vários aliados nativos americanos, incluindo povos Puebloan, que também queriam expulsar os americanos do território.
O governador provisório Charles Bent e vários outros americanos foram mortos pelos rebeldes. Em duas curtas campanhas, as tropas e milícias dos Estados Unidos esmagaram a rebelião dos povos Hispano e Pueblo. Os Novos Mexicanos, em busca de melhor representação, reagruparam-se e travaram mais três combates, mas depois de serem derrotados, abandonaram a guerra aberta. O ódio dos novos mexicanos pelo exército ocupante americano, combinado com a rebeldia frequentemente exercida pelos residentes de Taos contra a autoridade que lhes é imposta de outros lugares, foram as causas da revolta. No rescaldo da revolta, os americanos executaram pelo menos 28 rebeldes. O Tratado de Guadalupe Hidalgo em 1850 garantiu os direitos de propriedade dos residentes hispânicos e índios americanos do Novo México.