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A Guerra Filipino-Americana foi um conflito armado entre a Primeira República Filipina e os Estados Unidos que durou de 4 de fevereiro de 1899 a 2 de julho de 1902. O conflito surgiu em 1898, quando os Estados Unidos, em vez de reconhecer a declaração das Filipinas da independência, anexou as Filipinas ao abrigo do Tratado de Paris que concluiu coma Espanha para pôr fim à Guerra Hispano-Americana. A guerra pode ser vista como uma continuação da luta moderna das Filipinas pela independência, que começou em 1896 com a Revolução Filipina contra a Espanha e terminou em 1946 com a cessão da soberania pelos Estados Unidos.
Os combates eclodiram entre as forças dos Estados Unidos e as da República das Filipinas em 4 de fevereiro de 1899, no que ficou conhecido como a Batalha de Manila de 1899. Em 2 de junho de 1899, a Primeira República Filipina declarou oficialmente guerra contra os Estados Unidos. O presidente filipino Emilio Aguinaldo foi capturado em 23 de março de 1901, e a guerra foi oficialmente declarada encerrada pelo governo americano em 2 de julho de 1902, com vitória dos Estados Unidos. No entanto, alguns grupos filipinos – alguns liderados por veteranos do Katipunan, uma sociedade revolucionária filipina que lançou a revolução contra a Espanha – continuaram a combater as forças americanas durante mais vários anos. Entre esses líderes estava Macario Sakay, um membro veterano do Katipunan que estabeleceu (ou restabeleceu) a República Tagalog em 1902 ao longo das linhas Katipunan, em contraste com a República de Aguinaldo, sendo ele próprio como presidente. Outros grupos, incluindo os povos muçulmanos Moro do sul das Filipinas e os movimentos religiosos quase católicos Pulahan, continuaram as hostilidades em áreas remotas. A resistência nas províncias dominadas por Moro no sul, chamada de Rebelião Moro pelos americanos, terminou com a derrota final na Batalha de Bud Bagsak em 15 de junho de 1913.
A guerra resultou em pelo menos 200.000 mortes de civis filipinos, principalmente devido à fome e às doenças. Algumas estimativas do total de civis mortos chegam a um milhão. Algumas estimativas do total de civis mortos chegam a um milhão. Atrocidades e crimes de guerra foram cometidos durante o conflito, incluindo tortura, mutilação e execuções. Em retaliação às tácticas de guerrilha filipinas, os EUA levaram a cabo represálias e campanhas de terra arrasada, e realocaram à força muitos civis para campos de concentração, onde milhares de pessoas morreram. A guerra e a subsequente ocupação pelos EUA mudaram a cultura das ilhas, levando à ascensão do protestantismo e ao desestabilização da Igreja Católica e à introdução do inglês nas ilhas como língua principal do governo, da educação, dos negócios e da indústria.