Timur , também conhecido como Tamerlão, expandiu significativamente o seu império, incorporando vastas áreas do que hoje é o Afeganistão. Herat tornou-se uma capital proeminente do Império Timúrida sob seu governo, com o neto de Timur, Pir Muhammad, controlando Kandahar. As conquistas de Timur incluíram a reconstrução da infra-estrutura do Afeganistão, que tinha sido devastada pelas anteriores invasões mongóis. Sob a sua governação, a região registou progressos substanciais.
Após a morte de Timur em 1405, seu filho Shah Rukh mudou a capital timúrida para Herat, iniciando um período de florescimento cultural conhecido como Renascença Timúrida. Esta época viu Herat rivalizar com Florença como um centro de renascimento cultural, misturando as culturas turca e persa da Ásia Central e deixando um legado duradouro na paisagem cultural do Afeganistão.
No início do século 16, o domínio timúrida diminuiu com a ascensão de Babur em Cabul, outro descendente de Timur. Babur admirava Herat, uma vez notando sua beleza e importância incomparáveis. Seus empreendimentos levaram ao estabelecimento do Império Mughal naÍndia , marcando o início de influências indo-afegãs significativas no subcontinente.
No entanto, no século XVI, o oeste do Afeganistão caiu sob o domínio persa safávida , mudando mais uma vez o cenário político da região. Este período de domínio timúrida e subsequente domínio safávida sobre o Afeganistão contribuiu para a rica tapeçaria do património histórico e cultural do país, influenciando o seu desenvolvimento até à era moderna.