Edward eu estava agora livre de constrangimento no exterior e em casa e, depois de fazer os preparativos para a conquista final da Escócia , iniciou sua invasão em meados de maio de 1303. Seu exército foi organizado em duas divisões - uma sob si e a outra sob o príncipe de Gales. Edward avançou no leste e seu filho entrou na Escócia pelo oeste, mas seu avanço foi verificado em vários pontos por Wallace. O rei Edward chegou a Edimburgo em junho e depois marcharam por Linlithgow e Stirling para Perth. Comyn, com a pequena força sob seu comando, não podia esperar derrotar as forças de Edward. Edward ficou em Perth até julho, depois prosseguiu, via Dundee, Montrose e Brechin, até Aberdeen, chegando em agosto. A partir daí, ele marchou por Moray, antes de seu progresso continuar para Badenoch, antes de traçar seu caminho de volta para o sul até Dunfermline, onde ficou no inverno.
No início de 1304, Edward enviou uma festa de invasão para as fronteiras, que colocaram as forças sob Fraser e Wallace. Com o país agora sob submissão, todos os principais escoceses se renderam a Edward em fevereiro, exceto Wallace, Fraser e Soulis, que estava na França. Os termos de submissão foram negociados em 9 de fevereiro por John Comyn, que se recusou a se render incondicionalmente, mas pediu que os prisioneiros de ambos os lados fossem libertados por Ransom e que Edward concordou que não haveria represálias ou desferência dos escoceses.
Exceto William Wallace e John de Soulis, parecia que todos seriam perdoados depois que alguns dos líderes mais famosos foram exilados da Escócia por vários períodos. As propriedades perdidas podem ser recuperadas pelo pagamento de multas cobradas em valores considerados apropriados para a traição de cada indivíduo. As heranças continuariam como sempre tinham, permitindo que a nobreza da terra transmitisse títulos e propriedades normalmente.
De Soulis permaneceu no exterior, recusando -se a se render. Wallace ainda estava em liberdade na Escócia e, ao contrário de todos os nobres e bispos, se recusou a prestar homenagem a Edward. Edward precisava fazer um exemplo de alguém e, recusando -se a capitular e aceitar a ocupação e a anexação de seu país, Wallace se tornou o foco infeliz do ódio de Edward. Ele não receberia paz, a menos que se colocasse completamente e absolutamente sob a vontade de Edward. Também foi decretado que James Stewart, de Soulis e Sir Ingram de Umfraville não puderam voltar até que Wallace fosse desistido, e Comyn, Alexander Lindsay, David Graham e Simon Fraser procurarem ativamente sua captura.