O Centro de Treinamento Naval de Nagasaki foi um instituto de treinamento naval, entre 1855, quando foi criado pelo governo do xogunato Tokugawa, até 1859, quando foi transferido para Tsukiji em Edo. Durante o período Bakumatsu, o governo japonês enfrentou crescentes incursões de navios do mundo ocidental, com a intenção de pôr fim aos dois séculos de política externa isolacionista do país. Esses esforços acumularam-se no desembarque do comodoro dos Estados Unidos Matthew Perry em 1854, resultando no Tratado de Kanagawa e na abertura do Japão ao comércio exterior. O governo Tokugawa decidiu encomendar navios de guerra a vapor modernos e construir um centro de treinamento naval como parte de seus esforços de modernização para enfrentar a ameaça militar percebida representada pelas marinhas ocidentais mais avançadas.
Oficiais da Marinha Real Holandesa eram responsáveis pela educação. O currículo foi voltado para a navegação e as ciências ocidentais. O instituto de treinamento também foi equipado com o primeiro navio a vapor do Japão, Kankō Maru, oferecido pelo rei da Holanda em 1855. Mais tarde, juntou-se a ele o Kanrin Maru e o Chōyō.
A decisão de encerrar a Escola foi tomada por razões políticas, tanto do lado japonês como do lado holandês. Enquanto os Países Baixos temiam que as outras potências ocidentais suspeitassem que estavam a ajudar os japoneses a acumular poder naval para repelir os ocidentais, o Xogunato tornou-se relutante em dar aos samurais de domínios tradicionalmente anti-Tokugawa oportunidades de aprenderem tecnologia naval moderna. Embora o Centro de Treinamento Naval de Nagasaki tenha durado pouco, teve considerável influência direta e indireta na futura sociedade japonesa. O Centro de Treinamento Naval de Nagasaki educou muitos oficiais e engenheiros navais que mais tarde se tornariam não apenas fundadores da Marinha Imperial Japonesa, mas também promotores da construção naval japonesa e de outras indústrias.