Mongoolse invasies van Anatolië vonden op verschillende tijdstippen plaats, te beginnen met de campagne van 1241–1243 die culmineerde in de Slag om Köse Dağ. De echte macht over Anatolië werd uitgeoefend door de Mongolen nadat de Seltsjoeken zich in 1243 hadden overgegeven tot de val van het Ilkanaat in 1335. Hoewel Johannes III bang was dat ze hem als volgende zouden aanvallen, elimineerden ze uiteindelijk de Seltsjoekse dreiging voor Nicea. John III bereidde zich voor op de komende Mongoolse dreiging. Hij had echter gezanten naar de Qaghans Güyük en Möngke gestuurd, maar speelde tijdgebrek. Het Mongoolse rijk bracht geen schade toe aan zijn plan om Constantinopel te heroveren uit de handen van de Latijnen, die ook hun gezant naar de Mongolen stuurden.