1965 मा, बढ्दो तनावको सामना गर्दै र थप द्वन्द्व रोक्न, मलेसियाका प्रधानमन्त्री टुन्कु अब्दुल रहमानले मलेसियाबाट सिंगापुरलाई निष्कासन गर्ने प्रस्ताव गरे।यो सिफारिस पछि मलेसियाको संसदले 9 अगस्त 1965 मा सिंगापुरको अलगावको पक्षमा सर्वसम्मत मतको साथ अनुमोदन गर्यो।सोही दिन सिङ्गापुरका प्रधानमन्त्री ली कुआन युले सहर-राज्यको नयाँ स्वतन्त्रताको घोषणा गरे।सिंगापुरलाई एकपक्षीय रूपमा निष्कासन गरिएको जनविश्वासको विपरित, हालैका कागजातहरूले सिङ्गापुरको पिपुल्स एक्सन पार्टी (पीएपी) र मलेसियाको गठबन्धनबीच जुलाई १९६४ देखि छलफल चलिरहेको देखाएको छ। ली कुआन यू र पीएपीका वरिष्ठ नेता गोह केङ स्वीले आयोजना गरेका थिए। राजनैतिक र आर्थिक रूपमा फाइदा पुग्ने उद्देश्यले जनतासामु एक अपरिवर्तनीय निर्णयको रूपमा प्रस्तुत गर्ने तरिकामा विभाजन।^[१६]विभाजन पछि, सिंगापुरले संवैधानिक संशोधनहरू गर्यो जसले शहर-राज्यलाई सिंगापुर गणतन्त्रमा रूपान्तरण गर्यो।युसुफ इशाक, पहिले याङ डि-पर्टुआन नेगारा वा उप-शासकीय प्रतिनिधि, सिंगापुरको पहिलो राष्ट्रपतिको रूपमा उद्घाटन गरिएको थियो।जब मलाया र ब्रिटिश बोर्नियो डलर छोटो अवधिको लागि कानूनी मुद्राको रूपमा जारी रह्यो, सिंगापुर र मलेसिया बीच साझा मुद्राको बारेमा छलफलहरू 1967 मा सिंगापुर डलरको अन्ततः परिचय अघि आयोजित गरिएको थियो। ^[१७] मलेसियामा, संसदीय सीटहरू पहिले आयोजित सिंगापुरद्वारा मलायामा पुन: आवंटित गरियो, जसले सबा र सारावाक राज्यहरूद्वारा आयोजित शक्ति र प्रभावको सन्तुलनलाई परिवर्तन गर्‍यो।मलेसियाबाट सिंगापुरलाई अलग गर्ने निर्णयले कडा प्रतिक्रिया पाएको थियो, विशेष गरी सबा र सारवाकका नेताहरूबाट।यी नेताहरूले अलगावको प्रक्रियामा परामर्श नगरेकोमा विश्वासघात र निराशाको भावना व्यक्त गरे। साबाहका मुख्यमन्त्री फुआड स्टेफन्सले ली कुआन यूलाई लेखेको पत्रमा गहिरो दुःख व्यक्त गरे भने सारवाक युनाइटेड पिपुल्स पार्टीका ओङ की हुई जस्ता नेताहरूले प्रश्न गरे। विभाजन पछि मलेसियाको अस्तित्वको लागि धेरै तर्क।यी चिन्ताहरूको बावजुद, मलेसियाका उपप्रधानमन्त्री अब्दुल रजाक हुसेनले चलिरहेको इन्डोनेशिया-मलेसिया टकरावलाई यस कदमको गोप्यता र जरुरीतालाई श्रेय दिँदै निर्णयको बचाउ गरे।^[१८]