11 औं शताब्दीको उत्तरार्धमा, ख्वाराजमियन राजवंशले इराकमाथि नियन्त्रण ग्रहण गर्यो।टर्किक धर्मनिरपेक्ष शासनको यो अवधि र अब्बासिद खलिफा 13 औं शताब्दीमा मंगोल आक्रमणहरू संग समाप्त भयो।^[५१] चंगेज खानको नेतृत्वमा मङ्गोलहरूले १२२१ सम्म ख्वारेज्मियालाई जितेका थिए। यद्यपि, १२२७ मा चंगेज खानको मृत्यु र मंगोल साम्राज्य भित्रको शक्ति संघर्षका कारण इराकले अस्थायी राहतको अनुभव गर्यो।मोङ्के खान, 1251 बाट, मंगोल विस्तार पुन: सुरु भयो, र जब खलीफा अल-मुस्तासिमले मंगोलको मागलाई अस्वीकार गरे, बगदादले 1258 मा हुलागु खानको नेतृत्वमा घेराबन्दीको सामना गर्यो।बगदादको घेराबन्दी, मंगोल विजयहरूमा एक महत्त्वपूर्ण घटना, 29 जनवरी देखि 10 फेब्रुअरी 1258 सम्म 13 दिनसम्म फैलिएको थियो। इल्खानाते मङ्गोल सेनाहरूले आफ्ना सहयोगीहरूसँग घेरा हालेका थिए, कब्जा गरे र अन्ततः बगदाद, अब्बासी खलीफाको राजधानीलाई ध्वस्त पारे। ।यो घेराबन्दीले सहरका अधिकांश बासिन्दाहरूको नरसंहारको परिणामस्वरूप, सम्भावित रूपमा सयौं हजारहरूमा संख्यामा।सहरका पुस्तकालयहरू र तिनीहरूका बहुमूल्य सामग्रीहरूको विनाशको हदसम्म इतिहासकारहरू बीचको बहसको विषय बनेको छ।मंगोल सेनाहरूले अल-मुस्तासिमलाई मारिदिए र बगदादमा गम्भीर जनसङ्ख्या र विनाश ल्याए।यो घेराबन्दीले प्रतीकात्मक रूपमा इस्लामी स्वर्ण युगको अन्त्यलाई चिन्हित गर्‍यो, जुन अवधिमा खलीफाहरूले इबेरियन प्रायद्वीपबाट सिन्धसम्म आफ्नो प्रभुत्व विस्तार गरेका थिए।