Дэвид Маршалл Сингапурдың бірінші бас министрі болды, ол әлеуметтік толқуларға тап болған тұрақсыз үкіметті басқарды, мысалы, Хок Ли автобусындағы тәртіпсіздіктер.1956 жылы ол толық өзін-өзі басқару үшін Лондондағы келіссөздерге жетекшілік етті, бірақ британдық қауіпсіздік мәселелеріне байланысты келіссөздер сәтсіз аяқталды, бұл оның отставкаға кетуіне әкелді.Оның мұрагері Лим Ю Хок коммунистік және солшыл топтарға қарсы қатал позиция ұстанып,
британдықтардың 1958 жылы Сингапурға толық ішкі өзін-өзі басқаруына жол ашты.1959 жылғы сайлауда Ли Куан Ю басқарған Халықтық әрекет партиясы (ПАП) жеңіске жетіп, Ли Сингапурдың бірінші премьер-министрі болды.Оның үкіметі партияның коммунистік фракциясына байланысты алғашқы скептицизмге тап болды, бұл бизнестің Куала-Лумпурға көшуіне әкелді.Дегенмен, Лидің басшылығымен Сингапур экономикалық өсуді, білім беру реформаларын және агрессивті мемлекеттік тұрғын үй бағдарламасын көрді.Үкімет сонымен қатар еңбек толқуларын ауыздықтау және ағылшын тілін насихаттау шараларын қабылдады.Осы жетістіктерге қарамастан, PAP көшбасшылары Сингапурдың болашағы
Малайямен бірігуде деп сенді.Бұл идея қиындықтарға толы болды, әсіресе ПАП құрамындағы коммунистердің қарсылығы және Малайяның Біріккен Малайзия ұлттық ұйымының нәсілдік күштердің тепе-теңдігі туралы алаңдаушылықтары.Алайда, Сингапурдағы коммунистік билікті алу перспективасы біріктіру пайдасына көзқарастарды өзгертті.1961 жылы Малайяның премьер-министрі Тунку Абдул Рахман Малайзия, Сингапур, Бруней, Солтүстік Борнео және Саравак кіретін Малайзия Федерациясын құруды ұсынды.1962 жылы Сингапурда өткен референдум белгілі бір автономия шарттарына сәйкес бірігуді қолдайтынын көрсетті.