
Dopo le guerre hussite , la corona boema passò alla Casa d'Asburgo con Alberto, genero di Sigismondo, incoronato re. Il regno di Alberto fu breve e morì poco dopo. Il suo figlio postumo, Ladislao, ereditò il trono ma era troppo giovane per governare; la reggenza passò a Giorgio di Poděbrady, un nobile capace che guidò effettivamente la Boemia e in seguito fu incoronato a pieno titolo nel 1458. Conosciuto come il "Re dei due popoli", Giorgio mirava a mantenere l'equilibrio tra cattolici e hussiti, sostenendo la tolleranza religiosa e proponendo addirittura un’unione di pace europea. Tuttavia, il suo regno dovette affrontare l'opposizione dei nobili cattolici che formarono l'Unità della Montagna Verde e, dopo che Papa Paolo II lo scomunicò, il re ungherese Mattia Corvino lo invase, innescando la guerra boema- ungherese .
Alla morte di Giorgio nel 1471, Vladislao II della Casa di Jagellone salì al trono. Per porre fine alla guerra con Corvino, la pace di Olomouc nel 1479 divise i territori della Boemia, garantendo a Corvino il dominio su Moravia, Slesia e Lusazia. Ladislao II, tuttavia, ripristinò la pace religiosa con la pace di Kutná Hora nel 1485, consentendo ai nobili e alla gente comune di seguire liberamente il cattolicesimo o l'hussitismo. Quando Corvino morì nel 1490, Ladislao riconquistò le terre cedute e divenne anche re d'Ungheria, governando da Buda e stabilendo legami tra le dinastie Jagellone e Asburgo attraverso alleanze matrimoniali negoziate al Primo Congresso di Vienna.
Il figlio di Ladislao, Luigi II, gli succedette ma incontrò una tragica fine nella battaglia di Mohács nel 1526, dove le forze ottomane sconfissero l'esercito ungherese e Luigi annegò durante la ritirata. Senza eredi, la corona boema tornò agli Asburgo, in particolare a Ferdinando I, assicurando il controllo asburgico sulla Boemia e plasmando le dinamiche di potere dell'Europa centrale per i secoli a venire.