Heinäkuussa 1492
Espanjan uusi valtio karkotti juutalaiset ja muslimiväestönsä osana Espanjan inkvisitiota.Bayezid II lähetti ottomaanien laivaston amiraali Kemal Reisin komennossa Espanjaan vuonna 1492 evakuoidakseen ne turvallisesti ottomaanien maille.Hän lähetti julistuksia kaikkialle valtakuntaan, että pakolaiset oli otettava vastaan.
[6] Hän myönsi pakolaisille luvan asettua Ottomaanien valtakuntaan ja tulla ottomaanien kansalaisiksi.Hän pilkkasi Aragonian Ferdinand II:n ja Kastilialaisen Isabella I:n käytöstä karkotettaessa alamaisilleen niin hyödyllistä ihmisluokkaa."Te uskallatte kutsua Ferdinandia viisaaksi hallitsijaksi", hän sanoi hovimiehilleen, "joka on köyhdyttänyt oman maansa ja rikastanut minun!"
[7]Al-Andaluksen muslimit ja juutalaiset vaikuttivat suuresti Ottomaanien valtakunnan nousuun ottamalla käyttöön uusia ideoita, menetelmiä ja ammattitaitoa.Sefardijuutalaiset perustivat ensimmäisen kirjapainon Konstantinopoliin (nykyisin Istanbul). On kerrottu, että Bayezidin hallituskaudella juutalaiset nauttivat kulttuurin kukoistuksen ajanjaksosta, jolloin läsnä oli sellaisia tutkijoita kuin talmudistit ja tiedemies Mordecai Comtino;tähtitieteilijä ja runoilija Solomon ben Elijah Sharbiṭ ha-Zahab;Shabbethai ben Malkiel Cohen ja liturginen runoilija Menahem Tamar.