Válka proti Zikmundovi (1598–1599) byla stěžejním konfliktem ve švédské historii a znamenala definitivní rozchod mezi Švédskem a polsko - litevským společenstvím. Válka vypukla poté, co se Sigismund III Vasa, který byl švédským i polským králem, střetl se svým strýcem, vévodou Karlem ze Södermanlandu (později švédským Karlem IX.). Konflikt se soustředil na Karlův odpor vůči Sigismundově vládě, vedený obavami o Sigismundovu katolickou víru v převážně luteránském Švédsku a jeho opomenutí dodržovat dohody zaručující protestantům náboženskou svobodu.
Po Zikmundově korunovaci v roce 1594 se napětí vystupňovalo, když vévoda Karel, podporovaný švédskou šlechtou a luteránským duchovenstvem, se vzepřel královým příkazům a v Zikmundově nepřítomnosti ovládl Švédsko. Navzdory Zikmundovým pokusům získat zpět švédský trůn, včetně vylodění se silou polských a žoldnéřských vojsk v roce 1598, byly jeho snahy zmařeny. Stěžejním okamžikem byla Zikmundova porážka v bitvě u Stångebra v září 1598, po které byl nucen vzdát se kontroly nad Švédskem.
V roce 1599 byl Zikmund oficiálně sesazen švédským Riksdagem (parlamentem) a Karel upevnil svou moc a nakonec se stal králem Karlem IX. Toto ukončilo krátkou polsko-švédskou unii a zahájilo sérii válek mezi Švédskem a Polskem, přičemž Sigismundovy pokusy získat zpět švédskou korunu podněcovaly konflikty, které by trvaly celá desetiletí. Válka upevnila odklon Švédska od katolicismu a jeho politické zapojení s protestantismem za dynastie Vasa a utvářela jeho budoucnost jako hlavní evropské velmoci.